ZUT - Krajowe Ramy Kwalifikacji / Rok 2013/2014 / Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt / Biotechnologia (N2) / Biotechnologia w produkcji roślinnej / Sylabus przedmiotu

Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Biotechnologia (N2)
specjalność: Biotechnologia w produkcji roślinnej

Sylabus przedmiotu Genomika i transkryptomika:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów	Biotechnologia
Forma studiów	studia niestacjonarne	Poziom	drugiego stopnia
Tytuł zawodowy absolwenta	magister inżynier
Obszary studiów	nauk rolniczych, leśnych i weterynaryjnych, studiów inżynierskich
Profil	ogólnoakademicki
Moduł	—
Przedmiot	Genomika i transkryptomika
Specjalność	Bioinżynieria produkcji żywności
Jednostka prowadząca	Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt
Nauczyciel odpowiedzialny	Arkadiusz Terman <Arkadiusz.Terman@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele	Magdalena Jędrzejczak-Silicka <mjedrzejczak@zut.edu.pl>, Daniel Polasik <Daniel.Polasik@zut.edu.pl>, Iwona Szatkowska <Iwona.Szatkowska@zut.edu.pl>
ECTS (planowane)	3,0	ECTS (formy)	3,0
Forma zaliczenia	zaliczenie	Język	polski
Blok obieralny	—	Grupa obieralna	—

Formy dydaktyczne

Forma dydaktyczna	KOD	Semestr	Godziny	ECTS	Waga	Zaliczenie
laboratoria	L	3	7	1,5	0,41	zaliczenie
wykłady	W	3	8	1,5	0,59	zaliczenie

Wymagania wstępne

KOD	Wymaganie wstępne
W-1	Wiedza z zakresu genetyki molekularnej i inżynierii genetycznej

Cele przedmiotu

KOD	Cel modułu/przedmiotu
C-1	Przedstawienie zagadnień związanych analizą genomu
C-2	Przedstawienie projektów poznania genomów i metod ich realizacji
C-3	Zapoznanie z bazami danych jako formy prezentacji wyników analizy genomów

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KOD	Treść programowa	Godziny
laboratoria
T-L-1	Izolacja DNA plazmidowego.	1
T-L-2	Tworzenie mapy restrykcyjnej. Analiza restrykcyjna.	1
T-L-3	Izolacja i analiza mtDNA.	2
T-L-4	Izolacja całkowitego RNA, metody oczyszczania, analiza izolatów.	1
T-L-5	Metod analizy transkryptów RNA.	2
		7
wykłady
T-W-1	Rozwój dyscypliny, podstawowe pojęcia, ogólne prawa rządzące genomami. Poznawanie struktury i organizacji genomów różnych organizmów, sposoby identyfikacji genów, polimorfizm DNA i jego rodzaje, wykrywanie różnych typów polimorfizmów genetycznych.	1
T-W-2	Poznawanie funkcji poszczególnych elementów w genomie, badania nad poznaniem funkcjonowania całego genomu, badanie ekspresji wielu genów, analiza regulacji funkcjonowania genomu.	1
T-W-3	Molekularne podstawy ewolucji genomów. Mapowanie genomów.	1
T-W-4	Biblioteki genomowe i ekspresyjne.	1
T-W-5	Klasy RNA - właściwości, funkcje.	1
T-W-6	Analiza porónawcza transkryptomów różnych tkanek zwierzęcych.	1
T-W-7	Czynniki tranrypcyjne i ich rola w tkankowo specyficznej ekspresji.	1
T-W-8	Potranskrypcyjne modyfikacje RNA.	1
		8

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KOD	Forma aktywności	Godziny
laboratoria
A-L-1	Uczestnictwo w zajęciach.	7
A-L-2	Studiowanie podanej lteratury	15
A-L-3	Konsultacje	15
A-L-4	Przygotowanie do zaliczenia	7
A-L-5	Zaliczenie materiału	1
		45
wykłady
A-W-1	Uczestnictwo w zajęciach.	8
A-W-2	Samodzielne przygotowanie się do zaliczenia wykładów	15
A-W-3	Konsultacje z prowadzącym	15
A-W-4	Studiowanie literatury	7
		45

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KOD	Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1	Wykład wspomagany związany z zaplanowanymi treściami
M-2	Prezentacje multimedialne z zastosowaniem komputera i projektora
M-3	Praca w grupach laboratoryjnych

Sposoby oceny

KOD	Sposób oceny
S-1	Ocena formująca: Ocena aktywności i przygotowania na zajecia laboratoryjne
S-2	Ocena podsumowująca: Ocena za wiedze z zakresu przedstawionych wykładów oraz ćwiczen

Zamierzone efekty kształcenia - wiedza

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
BT_2A_BPŻ-S-C5_W01 W zakresie wiedzy student objaśnia zagadnienia z zakresu analizy sekwencji genomowych. Potrafi definiować metody realizacji projektów poznawania genomów ludzi i zwierząt.	BT_2A_W07	R2A_W03, R2A_W06	—	C-1, C-2, C-3	T-W-1, T-L-1, T-L-2, T-W-2, T-L-3, T-L-4, T-W-3, T-W-4, T-L-5, T-W-5, T-W-6, T-W-7, T-W-8	M-1, M-2, M-3	S-1, S-2
BT_2A_BPŻ-S-C5_W02 Posiada wiedzę z zakresu z transkryptomiki pod kątem analizy ekspresji genów i badaniem ich struktury oraz funkcji. Zapoznał z mechanizmami warunkującymi ewolucję genomu, jego rearanżację i odpowiedź na stresy.	BT_2A_W07	R2A_W03, R2A_W06	—	C-1, C-2, C-3	T-W-1, T-L-1, T-L-2, T-W-2, T-L-3, T-L-4, T-W-3, T-W-4, T-L-5, T-W-5, T-W-6, T-W-7, T-W-8	M-1, M-2, M-3	S-1, S-2

Zamierzone efekty kształcenia - umiejętności

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
BT_2A_BPŻ-S-C5_U01 Student pozyskał umiejętności całościowego spojrzenia na genom, uwzględniając zarówno jego strukturę i funkcję jak i aspekty dotyczące jego ewolucji.	BT_2A_U06	R2A_U01, R2A_U04, R2A_U05, R2A_U06, R2A_U07	InzA2_U02, InzA2_U06	C-1, C-2	T-W-2, T-W-3	M-1, M-2, M-3	S-1
BT_2A_BPŻ-S-C5_U02 Nabył umiejętności zaplanowania odpowiednich strategii badawczych dla poznania struktury genomu, jego funkcji i ewolucji. Poznał mechanizmy oraz czynniki zmniejszających stabilność genomu. Ponadto nabył miejętność zapoznania się z bazami danych zawierającymi zdeponowane dane o sekwencjach i genomach.	BT_2A_U06	R2A_U01, R2A_U04, R2A_U05, R2A_U06, R2A_U07	InzA2_U02, InzA2_U06	C-1, C-2, C-3	T-L-1, T-L-2, T-L-3, T-L-4, T-L-5, T-W-4, T-W-5, T-W-6, T-W-7, T-W-8	M-2, M-3	S-1

Zamierzone efekty kształcenia - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
BT_2A_BPŻ-S-C5_K01 Student potrafi kreowac aktywna postawę, ma zdolność do kompleksowego spojrzenia na analizowane fakty oraz widzi zagadnienia w szerszym kontekście.	BT_2A_K05	R2A_K03, R2A_K04	InzA2_K02	C-1, C-2, C-3	T-W-1, T-W-2, T-W-3	M-3	S-1

Kryterium oceny - wiedza

Efekt kształcenia	Ocena	Kryterium oceny
BT_2A_BPŻ-S-C5_W01 W zakresie wiedzy student objaśnia zagadnienia z zakresu analizy sekwencji genomowych. Potrafi definiować metody realizacji projektów poznawania genomów ludzi i zwierząt.	2,0	Student nie posiada wystarczającej wiedzy z zakresu sekwencji genomowych
	3,0	W zakresie wiedzy student objaśnia zagadnienia z zakresu analizy sekwencji genomowych. Potrafi definiować metody realizacji projektów poznawania genomów ludzi i zwierząt.
	3,5	Student posiada wystarczajacą wiedzę na temat poznawania projektów genomów różnych gatunków
	4,0	Student samodzielnie potrafi definiować i objaśniać zagdanienia związane z projektami gonomowymi
	4,5	Student ma szeroką i usystematyzowana wiedzą z zakresu poznawania genomów różnych gatunków.
	5,0	Student obok ugruntowanej wiedzy potrafi argumentować dobór określonych metod używanych w projektach genomowych
BT_2A_BPŻ-S-C5_W02 Posiada wiedzę z zakresu z transkryptomiki pod kątem analizy ekspresji genów i badaniem ich struktury oraz funkcji. Zapoznał z mechanizmami warunkującymi ewolucję genomu, jego rearanżację i odpowiedź na stresy.	2,0	Student nie posiada wystarczającej wiedzy z zakresu analizy ekspresji genów
	3,0	Posiada wiedzę z zakresu z transkryptomiki pod kątem analizy ekspresji genów i badaniem ich struktury oraz funkcji. Zapoznał z mechanizmami warunkującymi ewolucję genomu, jego rearanżację i odpowiedź na stresy.
	3,5	Student posiada wystarczajacą wiedzę na temat mechanizmów warunkujących rearanżację genomu
	4,0	Student samodzielnie potrafi analizować poszczególne funkcje genomu
	4,5	Student ma szeroką i usystematyzowana wiedzą z zakresu z zakresu transkryptomiki pod kątem badan genomowych
	5,0	Student posiada bogatą wiedzę oraz potrafi wyciągać wnioski z przedstawianej analizy oraz rearanżacji genomu

Kryterium oceny - umiejętności

Efekt kształcenia	Ocena	Kryterium oceny
BT_2A_BPŻ-S-C5_U01 Student pozyskał umiejętności całościowego spojrzenia na genom, uwzględniając zarówno jego strukturę i funkcję jak i aspekty dotyczące jego ewolucji.	2,0
	3,0	Student pozyskał umiejętności całościowego spojrzenia na genom, uwzględniając zarówno jego strukturę i funkcję jak i aspekty dotyczące jego ewolucji.
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0
BT_2A_BPŻ-S-C5_U02 Nabył umiejętności zaplanowania odpowiednich strategii badawczych dla poznania struktury genomu, jego funkcji i ewolucji. Poznał mechanizmy oraz czynniki zmniejszających stabilność genomu. Ponadto nabył miejętność zapoznania się z bazami danych zawierającymi zdeponowane dane o sekwencjach i genomach.	2,0
	3,0	Nabył umiejętności zaplanowania odpowiednich strategii badawczych dla poznania struktury genomu, jego funkcji i ewolucji. Poznał mechanizmy oraz czynniki zmniejszających stabilność genomu. Ponadto nabył miejętność zapoznania się z bazami danych zawierającymi zdeponowane dane o sekwencjach i genomach.
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne

Efekt kształcenia	Ocena	Kryterium oceny
BT_2A_BPŻ-S-C5_K01 Student potrafi kreowac aktywna postawę, ma zdolność do kompleksowego spojrzenia na analizowane fakty oraz widzi zagadnienia w szerszym kontekście.	2,0
	3,0	Student potrafi kreowac aktywna postawę, ma zdolność do kompleksowego spojrzenia na analizowane fakty oraz widzi zagadnienia w szerszym kontekście.
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Literatura podstawowa

Brown T.A., Genomy, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2001
Primrose S.B, Zasady analizy genomu, Wydawnictwa Naukowo-Techniczne, 1999
Węgleński P., Genetyka molekularna, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2006

Literatura dodatkowa

Bal J., Biologia molekularna w medycynie, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2001

Treści programowe - laboratoria

KOD	Treść programowa	Godziny
T-L-1	Izolacja DNA plazmidowego.	1
T-L-2	Tworzenie mapy restrykcyjnej. Analiza restrykcyjna.	1
T-L-3	Izolacja i analiza mtDNA.	2
T-L-4	Izolacja całkowitego RNA, metody oczyszczania, analiza izolatów.	1
T-L-5	Metod analizy transkryptów RNA.	2
		7

Treści programowe - wykłady

KOD	Treść programowa	Godziny
T-W-1	Rozwój dyscypliny, podstawowe pojęcia, ogólne prawa rządzące genomami. Poznawanie struktury i organizacji genomów różnych organizmów, sposoby identyfikacji genów, polimorfizm DNA i jego rodzaje, wykrywanie różnych typów polimorfizmów genetycznych.	1
T-W-2	Poznawanie funkcji poszczególnych elementów w genomie, badania nad poznaniem funkcjonowania całego genomu, badanie ekspresji wielu genów, analiza regulacji funkcjonowania genomu.	1
T-W-3	Molekularne podstawy ewolucji genomów. Mapowanie genomów.	1
T-W-4	Biblioteki genomowe i ekspresyjne.	1
T-W-5	Klasy RNA - właściwości, funkcje.	1
T-W-6	Analiza porónawcza transkryptomów różnych tkanek zwierzęcych.	1
T-W-7	Czynniki tranrypcyjne i ich rola w tkankowo specyficznej ekspresji.	1
T-W-8	Potranskrypcyjne modyfikacje RNA.	1
		8

Formy aktywności - laboratoria

KOD	Forma aktywności	Godziny
A-L-1	Uczestnictwo w zajęciach.	7
A-L-2	Studiowanie podanej lteratury	15
A-L-3	Konsultacje	15
A-L-4	Przygotowanie do zaliczenia	7
A-L-5	Zaliczenie materiału	1
		45

(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - wykłady

KOD	Forma aktywności	Godziny
A-W-1	Uczestnictwo w zajęciach.	8
A-W-2	Samodzielne przygotowanie się do zaliczenia wykładów	15
A-W-3	Konsultacje z prowadzącym	15
A-W-4	Studiowanie literatury	7
		45

(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BT_2A_BPŻ-S-C5_W01	W zakresie wiedzy student objaśnia zagadnienia z zakresu analizy sekwencji genomowych. Potrafi definiować metody realizacji projektów poznawania genomów ludzi i zwierząt.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BT_2A_W07	wykazuje pogłębioną wiedzę na temat budowy, funkcji oraz analizy komputerowej genów i genomów, metod dziedziczenia, jak również wpływu czynników genetycznych na kształtowanie środowiska
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	R2A_W03	ma pogłębioną wiedzę na temat biosfery, chemicznych i fizycznych procesów w niej zachodzących, podstaw techniki i kształtowania środowiska dostosowaną do studiowanego kierunku studiów
	R2A_W06	ma rozszerzoną wiedzę o roli i znaczeniu środowiska przyrodniczego i zrównoważonego użytkowania różnorodności biologicznej oraz o jego zagrożeniach
Cel przedmiotu	C-1	Przedstawienie zagadnień związanych analizą genomu
	C-2	Przedstawienie projektów poznania genomów i metod ich realizacji
	C-3	Zapoznanie z bazami danych jako formy prezentacji wyników analizy genomów
Treści programowe	T-W-1	Rozwój dyscypliny, podstawowe pojęcia, ogólne prawa rządzące genomami. Poznawanie struktury i organizacji genomów różnych organizmów, sposoby identyfikacji genów, polimorfizm DNA i jego rodzaje, wykrywanie różnych typów polimorfizmów genetycznych.
	T-L-1	Izolacja DNA plazmidowego.
	T-L-2	Tworzenie mapy restrykcyjnej. Analiza restrykcyjna.
	T-W-2	Poznawanie funkcji poszczególnych elementów w genomie, badania nad poznaniem funkcjonowania całego genomu, badanie ekspresji wielu genów, analiza regulacji funkcjonowania genomu.
	T-L-3	Izolacja i analiza mtDNA.
	T-L-4	Izolacja całkowitego RNA, metody oczyszczania, analiza izolatów.
	T-W-3	Molekularne podstawy ewolucji genomów. Mapowanie genomów.
	T-W-4	Biblioteki genomowe i ekspresyjne.
	T-L-5	Metod analizy transkryptów RNA.
	T-W-5	Klasy RNA - właściwości, funkcje.
	T-W-6	Analiza porónawcza transkryptomów różnych tkanek zwierzęcych.
	T-W-7	Czynniki tranrypcyjne i ich rola w tkankowo specyficznej ekspresji.
	T-W-8	Potranskrypcyjne modyfikacje RNA.
Metody nauczania	M-1	Wykład wspomagany związany z zaplanowanymi treściami
	M-2	Prezentacje multimedialne z zastosowaniem komputera i projektora
	M-3	Praca w grupach laboratoryjnych
Sposób oceny	S-1	Ocena formująca: Ocena aktywności i przygotowania na zajecia laboratoryjne
Sposób oceny	S-2	Ocena podsumowująca: Ocena za wiedze z zakresu przedstawionych wykładów oraz ćwiczen
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0	Student nie posiada wystarczającej wiedzy z zakresu sekwencji genomowych
	3,0	W zakresie wiedzy student objaśnia zagadnienia z zakresu analizy sekwencji genomowych. Potrafi definiować metody realizacji projektów poznawania genomów ludzi i zwierząt.
	3,5	Student posiada wystarczajacą wiedzę na temat poznawania projektów genomów różnych gatunków
	4,0	Student samodzielnie potrafi definiować i objaśniać zagdanienia związane z projektami gonomowymi
	4,5	Student ma szeroką i usystematyzowana wiedzą z zakresu poznawania genomów różnych gatunków.
	5,0	Student obok ugruntowanej wiedzy potrafi argumentować dobór określonych metod używanych w projektach genomowych

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BT_2A_BPŻ-S-C5_W02	Posiada wiedzę z zakresu z transkryptomiki pod kątem analizy ekspresji genów i badaniem ich struktury oraz funkcji. Zapoznał z mechanizmami warunkującymi ewolucję genomu, jego rearanżację i odpowiedź na stresy.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BT_2A_W07	wykazuje pogłębioną wiedzę na temat budowy, funkcji oraz analizy komputerowej genów i genomów, metod dziedziczenia, jak również wpływu czynników genetycznych na kształtowanie środowiska
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	R2A_W03	ma pogłębioną wiedzę na temat biosfery, chemicznych i fizycznych procesów w niej zachodzących, podstaw techniki i kształtowania środowiska dostosowaną do studiowanego kierunku studiów
	R2A_W06	ma rozszerzoną wiedzę o roli i znaczeniu środowiska przyrodniczego i zrównoważonego użytkowania różnorodności biologicznej oraz o jego zagrożeniach
Cel przedmiotu	C-1	Przedstawienie zagadnień związanych analizą genomu
	C-2	Przedstawienie projektów poznania genomów i metod ich realizacji
	C-3	Zapoznanie z bazami danych jako formy prezentacji wyników analizy genomów
Treści programowe	T-W-1	Rozwój dyscypliny, podstawowe pojęcia, ogólne prawa rządzące genomami. Poznawanie struktury i organizacji genomów różnych organizmów, sposoby identyfikacji genów, polimorfizm DNA i jego rodzaje, wykrywanie różnych typów polimorfizmów genetycznych.
	T-L-1	Izolacja DNA plazmidowego.
	T-L-2	Tworzenie mapy restrykcyjnej. Analiza restrykcyjna.
	T-W-2	Poznawanie funkcji poszczególnych elementów w genomie, badania nad poznaniem funkcjonowania całego genomu, badanie ekspresji wielu genów, analiza regulacji funkcjonowania genomu.
	T-L-3	Izolacja i analiza mtDNA.
	T-L-4	Izolacja całkowitego RNA, metody oczyszczania, analiza izolatów.
	T-W-3	Molekularne podstawy ewolucji genomów. Mapowanie genomów.
	T-W-4	Biblioteki genomowe i ekspresyjne.
	T-L-5	Metod analizy transkryptów RNA.
	T-W-5	Klasy RNA - właściwości, funkcje.
	T-W-6	Analiza porónawcza transkryptomów różnych tkanek zwierzęcych.
	T-W-7	Czynniki tranrypcyjne i ich rola w tkankowo specyficznej ekspresji.
	T-W-8	Potranskrypcyjne modyfikacje RNA.
Metody nauczania	M-1	Wykład wspomagany związany z zaplanowanymi treściami
	M-2	Prezentacje multimedialne z zastosowaniem komputera i projektora
	M-3	Praca w grupach laboratoryjnych
Sposób oceny	S-1	Ocena formująca: Ocena aktywności i przygotowania na zajecia laboratoryjne
Sposób oceny	S-2	Ocena podsumowująca: Ocena za wiedze z zakresu przedstawionych wykładów oraz ćwiczen
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0	Student nie posiada wystarczającej wiedzy z zakresu analizy ekspresji genów
	3,0	Posiada wiedzę z zakresu z transkryptomiki pod kątem analizy ekspresji genów i badaniem ich struktury oraz funkcji. Zapoznał z mechanizmami warunkującymi ewolucję genomu, jego rearanżację i odpowiedź na stresy.
	3,5	Student posiada wystarczajacą wiedzę na temat mechanizmów warunkujących rearanżację genomu
	4,0	Student samodzielnie potrafi analizować poszczególne funkcje genomu
	4,5	Student ma szeroką i usystematyzowana wiedzą z zakresu z zakresu transkryptomiki pod kątem badan genomowych
	5,0	Student posiada bogatą wiedzę oraz potrafi wyciągać wnioski z przedstawianej analizy oraz rearanżacji genomu

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BT_2A_BPŻ-S-C5_U01	Student pozyskał umiejętności całościowego spojrzenia na genom, uwzględniając zarówno jego strukturę i funkcję jak i aspekty dotyczące jego ewolucji.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BT_2A_U06	Potrafi wykorzystać techniki molekularne stosowane w taksonomii roślin, zwierząt i ludzi; rozumie budowę i funkcje genomu oraz transkryptomu organizmów eukariotycznych i prokariotycznych; zna procesy dziedziczenia i rozwoju organizmu; wykorzystuje metody molekularne w biotechnologii stosowanej; rozumie molekularne podstawy ewolucji; zna czynniki wpływające na zmienność organizmu.
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	R2A_U01	posiada umiejętność wyszukiwania, zrozumienia, analizy i twórczego wykorzystywania potrzebnych informacji pochodzących z różnych źródeł i w różnych formach właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	R2A_U04	samodzielnie planuje, przeprowadza, analizuje i ocenia poprawność wykonanego zadania z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	R2A_U05	samodzielnie i wszechstronnie analizuje problemy wpływające na produkcję i jakość żywności, zdrowie zwierząt i ludzi, stan środowiska naturalnego i zasobów naturalnych oraz wykazuje znajomość zastosowania specjalistycznych technik i ich optymalizacji dostosowanych do studiowanego kierunku studiów i profilu kształcenia
	R2A_U06	posiada umiejętność doboru i modyfikacji typowych działań (w tym technik i technologii) dostosowanych do zasobów przyrody w celu poprawy jakości życia człowieka, zgodnych ze studiowanym kierunkiem studiów
	R2A_U07	ocenia wady i zalety podjętych działań, w tym ich oryginalność w rozwiązywaniu zaistniałych problemów zawodowych - dla nabrania doświadczenia i doskonalenia kompetencji inżynierskich
Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	InzA2_U02	potrafi wykorzystać do formułowania i rozwiązywania zadań inżynierskich metody analityczne, symulacyjne oraz eksperymentalne
	InzA2_U06	potrafi dokonać identyfikacji i sformułować specyfikację prostych zadań inżynierskich o charakterze praktycznym, charakterystycznych dla studiowanego kierunku studiów
Cel przedmiotu	C-1	Przedstawienie zagadnień związanych analizą genomu
Cel przedmiotu	C-2	Przedstawienie projektów poznania genomów i metod ich realizacji
Treści programowe	T-W-2	Poznawanie funkcji poszczególnych elementów w genomie, badania nad poznaniem funkcjonowania całego genomu, badanie ekspresji wielu genów, analiza regulacji funkcjonowania genomu.
Treści programowe	T-W-3	Molekularne podstawy ewolucji genomów. Mapowanie genomów.
Metody nauczania	M-1	Wykład wspomagany związany z zaplanowanymi treściami
	M-2	Prezentacje multimedialne z zastosowaniem komputera i projektora
	M-3	Praca w grupach laboratoryjnych
Sposób oceny	S-1	Ocena formująca: Ocena aktywności i przygotowania na zajecia laboratoryjne
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Student pozyskał umiejętności całościowego spojrzenia na genom, uwzględniając zarówno jego strukturę i funkcję jak i aspekty dotyczące jego ewolucji.
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BT_2A_BPŻ-S-C5_U02	Nabył umiejętności zaplanowania odpowiednich strategii badawczych dla poznania struktury genomu, jego funkcji i ewolucji. Poznał mechanizmy oraz czynniki zmniejszających stabilność genomu. Ponadto nabył miejętność zapoznania się z bazami danych zawierającymi zdeponowane dane o sekwencjach i genomach.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BT_2A_U06	Potrafi wykorzystać techniki molekularne stosowane w taksonomii roślin, zwierząt i ludzi; rozumie budowę i funkcje genomu oraz transkryptomu organizmów eukariotycznych i prokariotycznych; zna procesy dziedziczenia i rozwoju organizmu; wykorzystuje metody molekularne w biotechnologii stosowanej; rozumie molekularne podstawy ewolucji; zna czynniki wpływające na zmienność organizmu.
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	R2A_U01	posiada umiejętność wyszukiwania, zrozumienia, analizy i twórczego wykorzystywania potrzebnych informacji pochodzących z różnych źródeł i w różnych formach właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	R2A_U04	samodzielnie planuje, przeprowadza, analizuje i ocenia poprawność wykonanego zadania z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	R2A_U05	samodzielnie i wszechstronnie analizuje problemy wpływające na produkcję i jakość żywności, zdrowie zwierząt i ludzi, stan środowiska naturalnego i zasobów naturalnych oraz wykazuje znajomość zastosowania specjalistycznych technik i ich optymalizacji dostosowanych do studiowanego kierunku studiów i profilu kształcenia
	R2A_U06	posiada umiejętność doboru i modyfikacji typowych działań (w tym technik i technologii) dostosowanych do zasobów przyrody w celu poprawy jakości życia człowieka, zgodnych ze studiowanym kierunkiem studiów
	R2A_U07	ocenia wady i zalety podjętych działań, w tym ich oryginalność w rozwiązywaniu zaistniałych problemów zawodowych - dla nabrania doświadczenia i doskonalenia kompetencji inżynierskich
Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	InzA2_U02	potrafi wykorzystać do formułowania i rozwiązywania zadań inżynierskich metody analityczne, symulacyjne oraz eksperymentalne
	InzA2_U06	potrafi dokonać identyfikacji i sformułować specyfikację prostych zadań inżynierskich o charakterze praktycznym, charakterystycznych dla studiowanego kierunku studiów
Cel przedmiotu	C-1	Przedstawienie zagadnień związanych analizą genomu
	C-2	Przedstawienie projektów poznania genomów i metod ich realizacji
	C-3	Zapoznanie z bazami danych jako formy prezentacji wyników analizy genomów
Treści programowe	T-L-1	Izolacja DNA plazmidowego.
	T-L-2	Tworzenie mapy restrykcyjnej. Analiza restrykcyjna.
	T-L-3	Izolacja i analiza mtDNA.
	T-L-4	Izolacja całkowitego RNA, metody oczyszczania, analiza izolatów.
	T-L-5	Metod analizy transkryptów RNA.
	T-W-4	Biblioteki genomowe i ekspresyjne.
	T-W-5	Klasy RNA - właściwości, funkcje.
	T-W-6	Analiza porónawcza transkryptomów różnych tkanek zwierzęcych.
	T-W-7	Czynniki tranrypcyjne i ich rola w tkankowo specyficznej ekspresji.
	T-W-8	Potranskrypcyjne modyfikacje RNA.
Metody nauczania	M-2	Prezentacje multimedialne z zastosowaniem komputera i projektora
Metody nauczania	M-3	Praca w grupach laboratoryjnych
Sposób oceny	S-1	Ocena formująca: Ocena aktywności i przygotowania na zajecia laboratoryjne
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Nabył umiejętności zaplanowania odpowiednich strategii badawczych dla poznania struktury genomu, jego funkcji i ewolucji. Poznał mechanizmy oraz czynniki zmniejszających stabilność genomu. Ponadto nabył miejętność zapoznania się z bazami danych zawierającymi zdeponowane dane o sekwencjach i genomach.
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BT_2A_BPŻ-S-C5_K01	Student potrafi kreowac aktywna postawę, ma zdolność do kompleksowego spojrzenia na analizowane fakty oraz widzi zagadnienia w szerszym kontekście.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BT_2A_K05	wykazuje zdyscyplinowanie w pracy indywidualnej; chętnie uczestniczy w pracy grupowej; potrafi kreatywnie planować i realizować działania własne i zespołowe
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	R2A_K03	potrafi odpowiednio określić priorytety służące realizacji określonego przez siebie lub innych zadania
	R2A_K04	prawidłowo identyfikuje i rozstrzyga dylematy związane z wykonywaniem zawodu
Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	InzA2_K02	potrafi myśleć i działać w sposób przedsiębiorczy
Cel przedmiotu	C-1	Przedstawienie zagadnień związanych analizą genomu
	C-2	Przedstawienie projektów poznania genomów i metod ich realizacji
	C-3	Zapoznanie z bazami danych jako formy prezentacji wyników analizy genomów
Treści programowe	T-W-1	Rozwój dyscypliny, podstawowe pojęcia, ogólne prawa rządzące genomami. Poznawanie struktury i organizacji genomów różnych organizmów, sposoby identyfikacji genów, polimorfizm DNA i jego rodzaje, wykrywanie różnych typów polimorfizmów genetycznych.
	T-W-2	Poznawanie funkcji poszczególnych elementów w genomie, badania nad poznaniem funkcjonowania całego genomu, badanie ekspresji wielu genów, analiza regulacji funkcjonowania genomu.
	T-W-3	Molekularne podstawy ewolucji genomów. Mapowanie genomów.
Metody nauczania	M-3	Praca w grupach laboratoryjnych
Sposób oceny	S-1	Ocena formująca: Ocena aktywności i przygotowania na zajecia laboratoryjne
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Student potrafi kreowac aktywna postawę, ma zdolność do kompleksowego spojrzenia na analizowane fakty oraz widzi zagadnienia w szerszym kontekście.
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0