Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie

Administracja Centralna Uczelni - Wymiana międzynarodowa (S2)

Sylabus przedmiotu Transcriptomics:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów Wymiana międzynarodowa
Forma studiów studia stacjonarne Poziom drugiego stopnia
Tytuł zawodowy absolwenta
Obszary studiów
Profil
Moduł
Przedmiot Transcriptomics
Specjalność przedmiot wspólny
Jednostka prowadząca Katedra Genetyki
Nauczyciel odpowiedzialny Andrzej Dybus <Andrzej.Dybus@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele
ECTS (planowane) 2,0 ECTS (formy) 2,0
Forma zaliczenia zaliczenie Język angielski
Blok obieralny Grupa obieralna

Formy dydaktyczne

Forma dydaktycznaKODSemestrGodzinyECTSWagaZaliczenie
laboratoriaL1 10 1,00,49zaliczenie
wykładyW1 10 1,00,51zaliczenie

Wymagania wstępne

KODWymaganie wstępne
W-1Basics of genetics and molecular biology

Cele przedmiotu

KODCel modułu/przedmiotu
C-1Knowledge of the RNA world and transcriptomic research

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KODTreść programowaGodziny
laboratoria
T-L-1Isolation of total RNA from different tissues.2
T-L-2Micro RNA (miRNA) isolation.2
T-L-3Agarose Gel Electrophoresis of RNA.2
T-L-4Reverse transcription (cDNA synthesis).2
T-L-5Analysis of gene expression - real time PCR.2
10
wykłady
T-W-1Introduction to transcriptomics. RNA classes.2
T-W-2RNA - biology and function. RNA interaction partners.2
T-W-3Diagnostics and therapies - RNA as a diagnostic tool.2
T-W-4RNA expression. DNA microarrays and RNA-Seq in transcriptomics.3
T-W-5RNA isolation – before it starts.1
10

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KODForma aktywnościGodziny
laboratoria
A-L-1Preparing for the laboratories classes5
A-L-2Participation in laboratory classes10
A-L-3Studying the literature of the subject7
A-L-4Consultations4
26
wykłady
A-W-1Participation in lectures10
A-W-2Studying recommended literature6
A-W-3Preparation for passing the test6
A-W-4Consultation3
25

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KODMetoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1Informative lectures with PP presentation
M-2Laboratory works

Sposoby oceny

KODSposób oceny
S-1Ocena podsumowująca: Writting the final test
S-2Ocena formująca: Assessment of preparation for laboratory classes and activity in the classroom

Zamierzone efekty uczenia się - wiedza

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
WM-WBiHZ_2-_null_W01
The student describes the variability of RNA, its biology and has knowledge of the methods of studying transcriptomes.
C-1T-W-1, T-W-5, T-W-2, T-W-4, T-W-3M-1, M-2S-1

Zamierzone efekty uczenia się - umiejętności

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
WM-WBiHZ_2-_null_U01
The student is able to prepare and perform the isolation of selected RNA fractions, perform cDNA synthesis and analyze gene expression by real time PCR.
C-1T-L-1, T-L-3, T-L-2, T-L-5, T-L-4, T-W-5M-2S-2

Zamierzone efekty uczenia się - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
WM-WBiHZ_2-_null_K01
The student is aware of the various methods of analyzing transcriptomic profiles
C-1T-L-1, T-L-3, T-L-2, T-L-5, T-L-4, T-W-1, T-W-5, T-W-2, T-W-4, T-W-3M-1, M-2S-1, S-2

Kryterium oceny - wiedza

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
WM-WBiHZ_2-_null_W01
The student describes the variability of RNA, its biology and has knowledge of the methods of studying transcriptomes.
2,0
3,0The student knows the basic classes of RNA, basic biological processes concerning RNA and research methods used in transcritomic research
3,5
4,0
4,5
5,0

Kryterium oceny - umiejętności

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
WM-WBiHZ_2-_null_U01
The student is able to prepare and perform the isolation of selected RNA fractions, perform cDNA synthesis and analyze gene expression by real time PCR.
2,0
3,0The student, with the help of the teacher, can perform the appropriate laboratory protocol.
3,5
4,0
4,5
5,0

Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
WM-WBiHZ_2-_null_K01
The student is aware of the various methods of analyzing transcriptomic profiles
2,0
3,0Student shows a moderate interest in participating in a verbal discussion with the teacher during the classes.
3,5
4,0
4,5
5,0

Literatura podstawowa

  1. E.A.MilwardA.ShahandehM.HeidariD.M.JohnstoneN.DaneshiH.Hondermarck, Transcriptomics, Encyclopedia of Cell Biology, 2016, Volume 4, 2016, Pages 160-165, https://doi.org/10.1016/B978-0-12-394447-4.40029-5
  2. T. A. Brown, Genomes 3 3rd Edition, Garland Science, 2006
  3. T. A. Brown, 4th Edition Genomes 4, Garland Science, 2017

Treści programowe - laboratoria

KODTreść programowaGodziny
T-L-1Isolation of total RNA from different tissues.2
T-L-2Micro RNA (miRNA) isolation.2
T-L-3Agarose Gel Electrophoresis of RNA.2
T-L-4Reverse transcription (cDNA synthesis).2
T-L-5Analysis of gene expression - real time PCR.2
10

Treści programowe - wykłady

KODTreść programowaGodziny
T-W-1Introduction to transcriptomics. RNA classes.2
T-W-2RNA - biology and function. RNA interaction partners.2
T-W-3Diagnostics and therapies - RNA as a diagnostic tool.2
T-W-4RNA expression. DNA microarrays and RNA-Seq in transcriptomics.3
T-W-5RNA isolation – before it starts.1
10

Formy aktywności - laboratoria

KODForma aktywnościGodziny
A-L-1Preparing for the laboratories classes5
A-L-2Participation in laboratory classes10
A-L-3Studying the literature of the subject7
A-L-4Consultations4
26
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - wykłady

KODForma aktywnościGodziny
A-W-1Participation in lectures10
A-W-2Studying recommended literature6
A-W-3Preparation for passing the test6
A-W-4Consultation3
25
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięWM-WBiHZ_2-_null_W01The student describes the variability of RNA, its biology and has knowledge of the methods of studying transcriptomes.
Cel przedmiotuC-1Knowledge of the RNA world and transcriptomic research
Treści programoweT-W-1Introduction to transcriptomics. RNA classes.
T-W-5RNA isolation – before it starts.
T-W-2RNA - biology and function. RNA interaction partners.
T-W-4RNA expression. DNA microarrays and RNA-Seq in transcriptomics.
T-W-3Diagnostics and therapies - RNA as a diagnostic tool.
Metody nauczaniaM-1Informative lectures with PP presentation
M-2Laboratory works
Sposób ocenyS-1Ocena podsumowująca: Writting the final test
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0The student knows the basic classes of RNA, basic biological processes concerning RNA and research methods used in transcritomic research
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięWM-WBiHZ_2-_null_U01The student is able to prepare and perform the isolation of selected RNA fractions, perform cDNA synthesis and analyze gene expression by real time PCR.
Cel przedmiotuC-1Knowledge of the RNA world and transcriptomic research
Treści programoweT-L-1Isolation of total RNA from different tissues.
T-L-3Agarose Gel Electrophoresis of RNA.
T-L-2Micro RNA (miRNA) isolation.
T-L-5Analysis of gene expression - real time PCR.
T-L-4Reverse transcription (cDNA synthesis).
T-W-5RNA isolation – before it starts.
Metody nauczaniaM-2Laboratory works
Sposób ocenyS-2Ocena formująca: Assessment of preparation for laboratory classes and activity in the classroom
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0The student, with the help of the teacher, can perform the appropriate laboratory protocol.
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięWM-WBiHZ_2-_null_K01The student is aware of the various methods of analyzing transcriptomic profiles
Cel przedmiotuC-1Knowledge of the RNA world and transcriptomic research
Treści programoweT-L-1Isolation of total RNA from different tissues.
T-L-3Agarose Gel Electrophoresis of RNA.
T-L-2Micro RNA (miRNA) isolation.
T-L-5Analysis of gene expression - real time PCR.
T-L-4Reverse transcription (cDNA synthesis).
T-W-1Introduction to transcriptomics. RNA classes.
T-W-5RNA isolation – before it starts.
T-W-2RNA - biology and function. RNA interaction partners.
T-W-4RNA expression. DNA microarrays and RNA-Seq in transcriptomics.
T-W-3Diagnostics and therapies - RNA as a diagnostic tool.
Metody nauczaniaM-1Informative lectures with PP presentation
M-2Laboratory works
Sposób ocenyS-1Ocena podsumowująca: Writting the final test
S-2Ocena formująca: Assessment of preparation for laboratory classes and activity in the classroom
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Student shows a moderate interest in participating in a verbal discussion with the teacher during the classes.
3,5
4,0
4,5
5,0