Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie

Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Biotechnologia (S2)
specjalność: Nanobioinżynieria

Sylabus przedmiotu Inżynieria enzymowa:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów Biotechnologia
Forma studiów studia stacjonarne Poziom drugiego stopnia
Tytuł zawodowy absolwenta magister inżynier
Obszary studiów charakterystyki PRK, kompetencje inżynierskie PRK
Profil ogólnoakademicki
Moduł
Przedmiot Inżynieria enzymowa
Specjalność Bioinżynieria
Jednostka prowadząca Katedra Mikrobiologii i Biotechnologii
Nauczyciel odpowiedzialny Radosław Drozd <Radoslaw.Drozd@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele
ECTS (planowane) 3,0 ECTS (formy) 3,0
Forma zaliczenia egzamin Język polski
Blok obieralny Grupa obieralna

Formy dydaktyczne

Forma dydaktycznaKODSemestrGodzinyECTSWagaZaliczenie
projektyP3 10 0,60,29zaliczenie
wykładyW3 15 1,00,42egzamin
laboratoriaL3 20 1,40,29zaliczenie

Wymagania wstępne

KODWymaganie wstępne
W-1Znajomość podstaw chemii organicznej i nieorganiczej, biochemii, biofizyki, chemii fizycznej, jezyka angielskiego w stopniu średnio zaawansowanym

Cele przedmiotu

KODCel modułu/przedmiotu
C-1Zapoznanie studenta z podstawami inzynieri białek katalitycznych
C-2Zapoznanie z metodami in silico predykcji struktur białkowych
C-3Wyuczenie umiejetności doboru odpowiednich metod służących do immobilizacji białek enzymowych

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KODTreść programowaGodziny
laboratoria
T-L-1Metody wizualizacji struktur białkowych z wykorzystaniem specjalistycznego oprogramowania. Analzia własciwości strukturalnych białek enzymatycznych.4
T-L-2Metody komputerowe rozwiązywania struktury II i III rzędu białek4
T-L-3Modelowanie parametrów kinetycznych enzymów6
T-L-4Projektowanie wektorów ekspresyjnych do produckji białek rekombinowanych. Oczyszczanie natywnych i rekombinowanych białek enzymatycznych.4
T-L-5Immobilizacja enzymów na matrycach organicznych i nieoragnicznych2
20
projekty
T-P-1Rozwiązywanie struktury i analiza własciwosci katalicznych białek enzymatycznych z wybranych klas.4
T-P-2Modelowanie parametrów operacyjnych enzymów z wykorzystaniem metod racjonalnego projektowania białek enzymatycznych.6
10
wykłady
T-W-1Funkcja i znaczenie struktury enzymów. Oddziaływania stabilizujące budowę białek enzymatycznych. Sposoby analizy struktury pierwszorzędowej białek enzymatycznych. Oddziaływania stabilizujące budowę białek. Sposoby analizy struktury drugorzędowej i trzeciorzędowej białek enzymatycznych2
T-W-2Metody przeszukiwania sekwencyjnych i strukturalnych białkowych baz danych. Programy, praktyczne podejście do porównywania struktury I, II i III rzędu enzymów. Metody rozwiązywania struktury 3D enzymów. Metody klasyczne (X-ray, NMR) vs modelowanie porównawcze i metody ab-initio.2
T-W-3Metody in-vitro modyfikacji i badania właściwości katalitycznych enzymów.2
T-W-4Modelowanie i optymalizacja parametrów kinetycznych enzymów. Przewidywanie i projektowanie in-silico właściwości katalitycznych enzymów2
T-W-5Metody stabilizacji i immobilizacji enzymów. Izolacja, oczyszczanie i frakcjonowanie enzymów3
T-W-6Mikrobiologiczna produkcja preparatów enzymatycznych. Rodzaje procesów fermentacyjnych. Projektowanie i optymalizacja bioreaktorów do produkcji enzymów na skalę przemysłową2
T-W-7Enzymy stosowane w remediacji środowiska i produkcji paliw ze źródeł odnawialnych, enzymy stosowane w gospodarstwie domowym, enzymy w przemyśle spożywczym i farmaceutycznym, enzymy w przemyśle tekstylnym i materiałowym.2
15

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KODForma aktywnościGodziny
laboratoria
A-L-1uczestnictwo w zajęciach20
A-L-2przygotowanie do zajęc laboratoryjnych10
A-L-3czytanie wskazanej literatury3
A-L-4konsultacje2
35
projekty
A-P-1uczestnictwo w zajęciach10
A-P-2przygotowanie do zajeć3
A-P-3czytanie wskazanej literatury2
15
wykłady
A-W-1uczestnictwo w zajęciach15
A-W-2konsultacje2
A-W-3przygotowanie do zajęć6
A-W-4egzamin2
25

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KODMetoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1wykład informacyjny
M-2opowiadanie
M-3anegdota
M-4wykład konwersatoryjny

Sposoby oceny

KODSposób oceny
S-1Ocena podsumowująca: Egzamin pisemny, test
S-2Ocena podsumowująca: Prezentacja multimedialna
S-3Ocena podsumowująca: Aprobata

Zamierzone efekty uczenia się - wiedza

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BTinz_2A_BI-S2-D06_W01
Posiada wiedzę zakresu strukturalnych zależności kształtujących własciwości katalityczne enzymów. Zna narzędzia kinforamtyczne pozwalające na przewidywanie struktury enzymów.
BTinz_2A_W07C-2, C-3, C-1T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4, T-L-2, T-L-3, T-P-1, T-P-2M-3, M-1, M-4, M-2S-1, S-2
BTinz_2A_BI-S2-D06_W02
Zna metody immobilizacji enzymów, sposoby przygotowania wysokooczyszczonych preparatów enzymatycznych.
BTinz_2A_W06, BTinz_2A_W07, BTinz_2A_W14C-2, C-3, C-1T-W-1, T-W-4, T-W-5, T-L-4, T-L-5M-3, M-1, M-4, M-2S-1, S-2
BTinz_2A_BI-S2-D06_W03
Zna sposoby selekcji mikroorganizmów do zadań aplikacyjnych mających na celu produkcję nzymó o określonej aktywności katalitycznej
BTinz_2A_W07C-2, C-3, C-1T-W-5, T-W-6, T-W-7, T-L-5, T-P-1, T-P-2M-3, M-1, M-4, M-2S-1, S-2

Zamierzone efekty uczenia się - umiejętności

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BTinz_2A_BI-S2-D06_U01
Korzysta z narzędzi bioinformatycznych do rozwiązywania struktury enzymów, potrafi poszukiwać zależnosci między ich strukturą a funkcjami katalitycznymi
BTinz_2A_U02, BTinz_2A_U07, BTinz_2A_U08C-2, C-3, C-1T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4M-3, M-1, M-4, M-2S-2
BTinz_2A_BI-S2-D06_U02
Analizuje metody pozwalające na unieczynianie enzymów, kalkuluje możliwości ich zastosowania w konkretnych aplikacjach
BTinz_2A_U07C-2, C-3, C-1T-W-4, T-W-5, T-W-6, T-L-5M-3, M-1, M-4, M-2S-2

Zamierzone efekty uczenia się - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BTinz_2A_BI-S2-D06_K01
Zna i wykorzystuje metody biotechnologiczne do polepsznaia jakości życia swojego i innych
BTinz_2A_K02, BTinz_2A_K03, BTinz_2A_K04C-2, C-3, C-1T-W-2, T-W-3, T-W-4, T-W-5, T-W-6, T-L-1, T-L-2, T-L-3, T-L-4, T-L-5, T-P-1, T-P-2M-3, M-1, M-4, M-2S-1, S-2

Kryterium oceny - wiedza

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
BTinz_2A_BI-S2-D06_W01
Posiada wiedzę zakresu strukturalnych zależności kształtujących własciwości katalityczne enzymów. Zna narzędzia kinforamtyczne pozwalające na przewidywanie struktury enzymów.
2,0
3,0Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin
3,5
4,0
4,5
5,0
BTinz_2A_BI-S2-D06_W02
Zna metody immobilizacji enzymów, sposoby przygotowania wysokooczyszczonych preparatów enzymatycznych.
2,0
3,0Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin
3,5
4,0
4,5
5,0
BTinz_2A_BI-S2-D06_W03
Zna sposoby selekcji mikroorganizmów do zadań aplikacyjnych mających na celu produkcję nzymó o określonej aktywności katalitycznej
2,0
3,0Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin
3,5
4,0
4,5
5,0

Kryterium oceny - umiejętności

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
BTinz_2A_BI-S2-D06_U01
Korzysta z narzędzi bioinformatycznych do rozwiązywania struktury enzymów, potrafi poszukiwać zależnosci między ich strukturą a funkcjami katalitycznymi
2,0
3,0Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin
3,5
4,0
4,5
5,0
BTinz_2A_BI-S2-D06_U02
Analizuje metody pozwalające na unieczynianie enzymów, kalkuluje możliwości ich zastosowania w konkretnych aplikacjach
2,0
3,0Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin
3,5
4,0
4,5
5,0

Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
BTinz_2A_BI-S2-D06_K01
Zna i wykorzystuje metody biotechnologiczne do polepsznaia jakości życia swojego i innych
2,0
3,0uczestnictwo w zajęciach
3,5poprawne wykonywanie poleceń prowadzącego, uczestnictwo w zajęcaich
4,0wykonanie konspektu z zajęc laboratoryjnych, poprawne wykonywanie poleceń prowadzącego, uczestnictwo w zajęcaich
4,5wykonanie konspektu z zajęc laboratoryjnych bez rążących błędów, poprawne wykonywanie poleceń prowadzącego, uczestnictwo w zajęciach,
5,0

Literatura podstawowa

  1. Jerzy Witwicki, Elementy enzymologii, PWN, Warszawa, 1984
  2. David Hawcroft, Diagnostic enzymology, ACOL, Londyn, 1986
  3. Wolfgang Aehle red., Enzymes in Industry: Production and Applications, Willey VCH, 2007, III
  4. Allan Svendsen, Enzyme Functionality: Design, Engineering and Screening, 2004
  5. Christoph Wittmann i Rainer Krull red., Biosystems Engineering I: Creating Superior Biocatalysts, Tom 1, Springer, 2010
  6. Girish Shukla i Ajit Varma, Soil Enzymology, Springer, 2011

Literatura dodatkowa

  1. Athel Cornish-Bowden, Fundamentals of Enzyme Kinetics, Portland Press, Londyn, 2002, III

Treści programowe - laboratoria

KODTreść programowaGodziny
T-L-1Metody wizualizacji struktur białkowych z wykorzystaniem specjalistycznego oprogramowania. Analzia własciwości strukturalnych białek enzymatycznych.4
T-L-2Metody komputerowe rozwiązywania struktury II i III rzędu białek4
T-L-3Modelowanie parametrów kinetycznych enzymów6
T-L-4Projektowanie wektorów ekspresyjnych do produckji białek rekombinowanych. Oczyszczanie natywnych i rekombinowanych białek enzymatycznych.4
T-L-5Immobilizacja enzymów na matrycach organicznych i nieoragnicznych2
20

Treści programowe - projekty

KODTreść programowaGodziny
T-P-1Rozwiązywanie struktury i analiza własciwosci katalicznych białek enzymatycznych z wybranych klas.4
T-P-2Modelowanie parametrów operacyjnych enzymów z wykorzystaniem metod racjonalnego projektowania białek enzymatycznych.6
10

Treści programowe - wykłady

KODTreść programowaGodziny
T-W-1Funkcja i znaczenie struktury enzymów. Oddziaływania stabilizujące budowę białek enzymatycznych. Sposoby analizy struktury pierwszorzędowej białek enzymatycznych. Oddziaływania stabilizujące budowę białek. Sposoby analizy struktury drugorzędowej i trzeciorzędowej białek enzymatycznych2
T-W-2Metody przeszukiwania sekwencyjnych i strukturalnych białkowych baz danych. Programy, praktyczne podejście do porównywania struktury I, II i III rzędu enzymów. Metody rozwiązywania struktury 3D enzymów. Metody klasyczne (X-ray, NMR) vs modelowanie porównawcze i metody ab-initio.2
T-W-3Metody in-vitro modyfikacji i badania właściwości katalitycznych enzymów.2
T-W-4Modelowanie i optymalizacja parametrów kinetycznych enzymów. Przewidywanie i projektowanie in-silico właściwości katalitycznych enzymów2
T-W-5Metody stabilizacji i immobilizacji enzymów. Izolacja, oczyszczanie i frakcjonowanie enzymów3
T-W-6Mikrobiologiczna produkcja preparatów enzymatycznych. Rodzaje procesów fermentacyjnych. Projektowanie i optymalizacja bioreaktorów do produkcji enzymów na skalę przemysłową2
T-W-7Enzymy stosowane w remediacji środowiska i produkcji paliw ze źródeł odnawialnych, enzymy stosowane w gospodarstwie domowym, enzymy w przemyśle spożywczym i farmaceutycznym, enzymy w przemyśle tekstylnym i materiałowym.2
15

Formy aktywności - laboratoria

KODForma aktywnościGodziny
A-L-1uczestnictwo w zajęciach20
A-L-2przygotowanie do zajęc laboratoryjnych10
A-L-3czytanie wskazanej literatury3
A-L-4konsultacje2
35
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - projekty

KODForma aktywnościGodziny
A-P-1uczestnictwo w zajęciach10
A-P-2przygotowanie do zajeć3
A-P-3czytanie wskazanej literatury2
15
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - wykłady

KODForma aktywnościGodziny
A-W-1uczestnictwo w zajęciach15
A-W-2konsultacje2
A-W-3przygotowanie do zajęć6
A-W-4egzamin2
25
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięBTinz_2A_BI-S2-D06_W01Posiada wiedzę zakresu strukturalnych zależności kształtujących własciwości katalityczne enzymów. Zna narzędzia kinforamtyczne pozwalające na przewidywanie struktury enzymów.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBTinz_2A_W07ma rozszerzoną wiedzę z zakresu procesów inżynierskich, urządzeń i linii technologicznych wykorzystywanych w biotechnologii
Cel przedmiotuC-2Zapoznanie z metodami in silico predykcji struktur białkowych
C-3Wyuczenie umiejetności doboru odpowiednich metod służących do immobilizacji białek enzymowych
C-1Zapoznanie studenta z podstawami inzynieri białek katalitycznych
Treści programoweT-W-1Funkcja i znaczenie struktury enzymów. Oddziaływania stabilizujące budowę białek enzymatycznych. Sposoby analizy struktury pierwszorzędowej białek enzymatycznych. Oddziaływania stabilizujące budowę białek. Sposoby analizy struktury drugorzędowej i trzeciorzędowej białek enzymatycznych
T-W-2Metody przeszukiwania sekwencyjnych i strukturalnych białkowych baz danych. Programy, praktyczne podejście do porównywania struktury I, II i III rzędu enzymów. Metody rozwiązywania struktury 3D enzymów. Metody klasyczne (X-ray, NMR) vs modelowanie porównawcze i metody ab-initio.
T-W-3Metody in-vitro modyfikacji i badania właściwości katalitycznych enzymów.
T-W-4Modelowanie i optymalizacja parametrów kinetycznych enzymów. Przewidywanie i projektowanie in-silico właściwości katalitycznych enzymów
T-L-2Metody komputerowe rozwiązywania struktury II i III rzędu białek
T-L-3Modelowanie parametrów kinetycznych enzymów
T-P-1Rozwiązywanie struktury i analiza własciwosci katalicznych białek enzymatycznych z wybranych klas.
T-P-2Modelowanie parametrów operacyjnych enzymów z wykorzystaniem metod racjonalnego projektowania białek enzymatycznych.
Metody nauczaniaM-3anegdota
M-1wykład informacyjny
M-4wykład konwersatoryjny
M-2opowiadanie
Sposób ocenyS-1Ocena podsumowująca: Egzamin pisemny, test
S-2Ocena podsumowująca: Prezentacja multimedialna
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięBTinz_2A_BI-S2-D06_W02Zna metody immobilizacji enzymów, sposoby przygotowania wysokooczyszczonych preparatów enzymatycznych.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBTinz_2A_W06posiada znajomość zaawansowanych metod laboratoryjnych, technik i narzędzi inżynierskich pozwalających na wykonywanie technicznych zadań dostosowanych do kierunku biotechnologia
BTinz_2A_W07ma rozszerzoną wiedzę z zakresu procesów inżynierskich, urządzeń i linii technologicznych wykorzystywanych w biotechnologii
BTinz_2A_W14zna zaawansowane techniki bioinformatyczne i możliwości ich wykorzystania w biotechnologii
Cel przedmiotuC-2Zapoznanie z metodami in silico predykcji struktur białkowych
C-3Wyuczenie umiejetności doboru odpowiednich metod służących do immobilizacji białek enzymowych
C-1Zapoznanie studenta z podstawami inzynieri białek katalitycznych
Treści programoweT-W-1Funkcja i znaczenie struktury enzymów. Oddziaływania stabilizujące budowę białek enzymatycznych. Sposoby analizy struktury pierwszorzędowej białek enzymatycznych. Oddziaływania stabilizujące budowę białek. Sposoby analizy struktury drugorzędowej i trzeciorzędowej białek enzymatycznych
T-W-4Modelowanie i optymalizacja parametrów kinetycznych enzymów. Przewidywanie i projektowanie in-silico właściwości katalitycznych enzymów
T-W-5Metody stabilizacji i immobilizacji enzymów. Izolacja, oczyszczanie i frakcjonowanie enzymów
T-L-4Projektowanie wektorów ekspresyjnych do produckji białek rekombinowanych. Oczyszczanie natywnych i rekombinowanych białek enzymatycznych.
T-L-5Immobilizacja enzymów na matrycach organicznych i nieoragnicznych
Metody nauczaniaM-3anegdota
M-1wykład informacyjny
M-4wykład konwersatoryjny
M-2opowiadanie
Sposób ocenyS-1Ocena podsumowująca: Egzamin pisemny, test
S-2Ocena podsumowująca: Prezentacja multimedialna
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięBTinz_2A_BI-S2-D06_W03Zna sposoby selekcji mikroorganizmów do zadań aplikacyjnych mających na celu produkcję nzymó o określonej aktywności katalitycznej
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBTinz_2A_W07ma rozszerzoną wiedzę z zakresu procesów inżynierskich, urządzeń i linii technologicznych wykorzystywanych w biotechnologii
Cel przedmiotuC-2Zapoznanie z metodami in silico predykcji struktur białkowych
C-3Wyuczenie umiejetności doboru odpowiednich metod służących do immobilizacji białek enzymowych
C-1Zapoznanie studenta z podstawami inzynieri białek katalitycznych
Treści programoweT-W-5Metody stabilizacji i immobilizacji enzymów. Izolacja, oczyszczanie i frakcjonowanie enzymów
T-W-6Mikrobiologiczna produkcja preparatów enzymatycznych. Rodzaje procesów fermentacyjnych. Projektowanie i optymalizacja bioreaktorów do produkcji enzymów na skalę przemysłową
T-W-7Enzymy stosowane w remediacji środowiska i produkcji paliw ze źródeł odnawialnych, enzymy stosowane w gospodarstwie domowym, enzymy w przemyśle spożywczym i farmaceutycznym, enzymy w przemyśle tekstylnym i materiałowym.
T-L-5Immobilizacja enzymów na matrycach organicznych i nieoragnicznych
T-P-1Rozwiązywanie struktury i analiza własciwosci katalicznych białek enzymatycznych z wybranych klas.
T-P-2Modelowanie parametrów operacyjnych enzymów z wykorzystaniem metod racjonalnego projektowania białek enzymatycznych.
Metody nauczaniaM-3anegdota
M-1wykład informacyjny
M-4wykład konwersatoryjny
M-2opowiadanie
Sposób ocenyS-1Ocena podsumowująca: Egzamin pisemny, test
S-2Ocena podsumowująca: Prezentacja multimedialna
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięBTinz_2A_BI-S2-D06_U01Korzysta z narzędzi bioinformatycznych do rozwiązywania struktury enzymów, potrafi poszukiwać zależnosci między ich strukturą a funkcjami katalitycznymi
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBTinz_2A_U02umie zaplanować i analizować badania biotechnologiczne z wykorzystaniem narzędzi bioinformatycznych
BTinz_2A_U07analizuje główne szlaki metaboliczne oraz mechanizmy ich regulacji w oparciu o wiedzę z zakresu budowy i funkcji białek, hormonów i witamin; potrafi pozyskiwać i wykorzystywać enzymy
BTinz_2A_U08dobiera i stosuje zaawansowane techniki i narzędzia badawcze wykorzystywane w biotechnologii
Cel przedmiotuC-2Zapoznanie z metodami in silico predykcji struktur białkowych
C-3Wyuczenie umiejetności doboru odpowiednich metod służących do immobilizacji białek enzymowych
C-1Zapoznanie studenta z podstawami inzynieri białek katalitycznych
Treści programoweT-W-1Funkcja i znaczenie struktury enzymów. Oddziaływania stabilizujące budowę białek enzymatycznych. Sposoby analizy struktury pierwszorzędowej białek enzymatycznych. Oddziaływania stabilizujące budowę białek. Sposoby analizy struktury drugorzędowej i trzeciorzędowej białek enzymatycznych
T-W-2Metody przeszukiwania sekwencyjnych i strukturalnych białkowych baz danych. Programy, praktyczne podejście do porównywania struktury I, II i III rzędu enzymów. Metody rozwiązywania struktury 3D enzymów. Metody klasyczne (X-ray, NMR) vs modelowanie porównawcze i metody ab-initio.
T-W-3Metody in-vitro modyfikacji i badania właściwości katalitycznych enzymów.
T-W-4Modelowanie i optymalizacja parametrów kinetycznych enzymów. Przewidywanie i projektowanie in-silico właściwości katalitycznych enzymów
Metody nauczaniaM-3anegdota
M-1wykład informacyjny
M-4wykład konwersatoryjny
M-2opowiadanie
Sposób ocenyS-2Ocena podsumowująca: Prezentacja multimedialna
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięBTinz_2A_BI-S2-D06_U02Analizuje metody pozwalające na unieczynianie enzymów, kalkuluje możliwości ich zastosowania w konkretnych aplikacjach
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBTinz_2A_U07analizuje główne szlaki metaboliczne oraz mechanizmy ich regulacji w oparciu o wiedzę z zakresu budowy i funkcji białek, hormonów i witamin; potrafi pozyskiwać i wykorzystywać enzymy
Cel przedmiotuC-2Zapoznanie z metodami in silico predykcji struktur białkowych
C-3Wyuczenie umiejetności doboru odpowiednich metod służących do immobilizacji białek enzymowych
C-1Zapoznanie studenta z podstawami inzynieri białek katalitycznych
Treści programoweT-W-4Modelowanie i optymalizacja parametrów kinetycznych enzymów. Przewidywanie i projektowanie in-silico właściwości katalitycznych enzymów
T-W-5Metody stabilizacji i immobilizacji enzymów. Izolacja, oczyszczanie i frakcjonowanie enzymów
T-W-6Mikrobiologiczna produkcja preparatów enzymatycznych. Rodzaje procesów fermentacyjnych. Projektowanie i optymalizacja bioreaktorów do produkcji enzymów na skalę przemysłową
T-L-5Immobilizacja enzymów na matrycach organicznych i nieoragnicznych
Metody nauczaniaM-3anegdota
M-1wykład informacyjny
M-4wykład konwersatoryjny
M-2opowiadanie
Sposób ocenyS-2Ocena podsumowująca: Prezentacja multimedialna
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięBTinz_2A_BI-S2-D06_K01Zna i wykorzystuje metody biotechnologiczne do polepsznaia jakości życia swojego i innych
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBTinz_2A_K02wykazuje zrozumienie procesów biotechnologicznych wykorzystywanych w różnych obszarach działalności człowieka; interpretuje i opisuje te procesy wykorzystując podejście naukowe
BTinz_2A_K03ma świadomość wpływu biotechnologii na kształtowanie i stan środowiska naturalnego oraz zdrowie człowieka
BTinz_2A_K04ma świadomość istnienia norm etycznych i społecznych związanych z prowadzoną pracą badawczą i działalnością zawodową; rozumie celowość postępowania zgodnie z wytyczonymi zasadami etycznymi i prawnymi
Cel przedmiotuC-2Zapoznanie z metodami in silico predykcji struktur białkowych
C-3Wyuczenie umiejetności doboru odpowiednich metod służących do immobilizacji białek enzymowych
C-1Zapoznanie studenta z podstawami inzynieri białek katalitycznych
Treści programoweT-W-2Metody przeszukiwania sekwencyjnych i strukturalnych białkowych baz danych. Programy, praktyczne podejście do porównywania struktury I, II i III rzędu enzymów. Metody rozwiązywania struktury 3D enzymów. Metody klasyczne (X-ray, NMR) vs modelowanie porównawcze i metody ab-initio.
T-W-3Metody in-vitro modyfikacji i badania właściwości katalitycznych enzymów.
T-W-4Modelowanie i optymalizacja parametrów kinetycznych enzymów. Przewidywanie i projektowanie in-silico właściwości katalitycznych enzymów
T-W-5Metody stabilizacji i immobilizacji enzymów. Izolacja, oczyszczanie i frakcjonowanie enzymów
T-W-6Mikrobiologiczna produkcja preparatów enzymatycznych. Rodzaje procesów fermentacyjnych. Projektowanie i optymalizacja bioreaktorów do produkcji enzymów na skalę przemysłową
T-L-1Metody wizualizacji struktur białkowych z wykorzystaniem specjalistycznego oprogramowania. Analzia własciwości strukturalnych białek enzymatycznych.
T-L-2Metody komputerowe rozwiązywania struktury II i III rzędu białek
T-L-3Modelowanie parametrów kinetycznych enzymów
T-L-4Projektowanie wektorów ekspresyjnych do produckji białek rekombinowanych. Oczyszczanie natywnych i rekombinowanych białek enzymatycznych.
T-L-5Immobilizacja enzymów na matrycach organicznych i nieoragnicznych
T-P-1Rozwiązywanie struktury i analiza własciwosci katalicznych białek enzymatycznych z wybranych klas.
T-P-2Modelowanie parametrów operacyjnych enzymów z wykorzystaniem metod racjonalnego projektowania białek enzymatycznych.
Metody nauczaniaM-3anegdota
M-1wykład informacyjny
M-4wykład konwersatoryjny
M-2opowiadanie
Sposób ocenyS-1Ocena podsumowująca: Egzamin pisemny, test
S-2Ocena podsumowująca: Prezentacja multimedialna
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0uczestnictwo w zajęciach
3,5poprawne wykonywanie poleceń prowadzącego, uczestnictwo w zajęcaich
4,0wykonanie konspektu z zajęc laboratoryjnych, poprawne wykonywanie poleceń prowadzącego, uczestnictwo w zajęcaich
4,5wykonanie konspektu z zajęc laboratoryjnych bez rążących błędów, poprawne wykonywanie poleceń prowadzącego, uczestnictwo w zajęciach,
5,0