ZUT - Krajowe Ramy Kwalifikacji / Rok 2012/2013 / Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt / Biologia (S2) / Sylabus przedmiotu

Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Biologia (S2)

Sylabus przedmiotu Markery genetyczne:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów	Biologia
Forma studiów	studia stacjonarne	Poziom	drugiego stopnia
Tytuł zawodowy absolwenta	magister
Obszary studiów	nauk przyrodniczych
Profil	ogólnoakademicki
Moduł	—
Przedmiot	Markery genetyczne
Specjalność	Biologia molekularna i podstawy analityki
Jednostka prowadząca	Katedra Nauk o Zwierzętach Przeżuwających
Nauczyciel odpowiedzialny	Andrzej Dybus <Andrzej.Dybus@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele
ECTS (planowane)	2,0	ECTS (formy)	2,0
Forma zaliczenia	zaliczenie	Język	polski
Blok obieralny	—	Grupa obieralna	—

Formy dydaktyczne

Forma dydaktyczna	KOD	Semestr	Godziny	ECTS	Waga	Zaliczenie
laboratoria	L	3	30	1,5	0,41	zaliczenie
wykłady	W	3	10	0,5	0,59	zaliczenie

Wymagania wstępne

KOD	Wymaganie wstępne
W-1	Student powinien posiadać wiadomości z zakresu genetyki ogólnej oraz biologii molekularnej.

Cele przedmiotu

KOD	Cel modułu/przedmiotu
C-1	Celem przedmiotu jest zapoznanie studenta z markerami genetycznymi.
C-2	Przybliżenie aktualnych metod molekularnych stosowanych w celu identyfikacji i analizy markerów genetycznych.
C-3	Wskazanie sposobów poszukiwania nowych markerów genetycznych.

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KOD	Treść programowa	Godziny
laboratoria
T-L-1	Zasady BHP w laboratorium. Obsługa urządzeń laboratoryjnych. Przygotowanie stanowisk do pracy.	2
T-L-2	Izolacja kwasów nukleinowych z różnych tkanek. Porównanie metod izolacji DNA.	2
T-L-3	Preparatyka RNA. Metody zabezpieczania RNA przed degradacją.	2
T-L-4	Jakościowa oraz ilościowa ocena preparatów kwasów nukleinowych.	2
T-L-5	Techniki wykorzystywane w identyfikacji markerów genetycznych. PCR, PCR-RFLP, PCR-ACRS cz.1	2
T-L-6	Techniki wykorzystywane w identyfikacji markerów genetycznych. PCR-indel, PCR-multipleks, LONG-PCR cz.2	2
T-L-7	Wykrywanie nieznanych mutacji w sekwencjach DNA. PCR-SSCP.Elektroforeza poliakrylamidowa. Barwienie DNA srebrem.	2
T-L-8	Diagnostyka chorób genetcznych. Polimorfizm indel genu PRNP owcy.	2
T-L-9	Markery molekularne płci. Ustalanie płci ssaków i ptaków.	2
T-L-10	Markery genetyczne otłuszczenia i umięśnienia. Polimorfizm genów leptyny i miostatyny.	2
T-L-11	Analiza ekspresji genów cz.1 RT-PCR, półilościowa ocena poziomu ekspresji genów.	2
T-L-12	Analiza ekspresji genów cz.2. real time-PCR, ilościowa ocena poziomu ekspresji genów.	2
T-L-13	Markery genetyczne w identyfikacji gatunkowej. Międzygatunkowa analiza sekwencjii mtDNA wybranych gatunków.	2
T-L-14	Markery genetyczne w identyfikacji osobniczej. Sekwencje powtórzone (STR, VNTR).	2
T-L-15	Analiza wyników sekwencjonowania DNA.	2
		30
wykłady
T-W-1	Definicje markerów genetycznych. Organizacja genomu ssaków. Charakterystyka markerów klasy I i II oraz możliwości ich wykorzystania w analizie wybranych cech u ssaków. Markery cytogenetyczne.	2
T-W-2	Wykorzystanie martkerów molekularnych i cytogenetycznych w diagnostyce wad rozwojowych.	2
T-W-3	Markery genetyczne w prognozowaniu otłuszczenia u ssaków na modelu mysim.	2
T-W-4	Proces starzenia się - choroba genetyczna czy stan fizjologiczny? Progeria i przypadek Brooke Greenberg a merkery genetyczne starzenia się ssakówe.	2
T-W-5	Prosta definicja płci a złożony proces determinacji i różnicowania płciowego u ssków. Identyfikacja płci z wykorzystaniem markerów molekularnych.	2
		10

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KOD	Forma aktywności	Godziny
laboratoria
A-L-1	Uczestnictwo w zajęciach laboratoryjnych.	30
A-L-2	Samodzielne poszerzanie wiedzy teoretycznej.	5
A-L-3	Przygotowanie do zaliczenia materiału.	10
		45
wykłady
A-W-1	Udział studenta w przeprowadzonych wykładach	10
A-W-2	Przygotowanie się do zaliczenia.	5
		15

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KOD	Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1	Metody podające (wykład informacyjny, pogadanka, objaśnienie).
M-2	Metody problemowe (wykład problemowy, wykład konwersatoryjny).
M-3	Metody praktyczne (ćwiczenia laboratoryjne, metoda projektów).

Sposoby oceny

KOD	Sposób oceny
S-1	Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie wykładów.
S-2	Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.

Zamierzone efekty kształcenia - wiedza

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
BL_2A_BLM-S-B7_W01 Definiuje typy markerów genetycznych.	BL_2A_W12	P2A_W01, P2A_W05, P2A_W07	C-1	T-W-1	M-1	S-1
BL_2A_BLM-S-B7_W02 Rozróżnia choroby genetyczne dziedziczone autosomalnie recesywnie i dominująco. Objaśnia mechanizmy genetycznej determinacji otłuszczenia, miognezy, starzenia się organizmu oraz zaburzeń determinacji płci.	BL_2A_W12, BL_2A_W11	P2A_W01, P2A_W04, P2A_W05, P2A_W07	C-3	T-W-5, T-W-3, T-W-4, T-W-2	M-1, M-2	S-1
BL_2A_BLM-S-B7_W03 Rozróżnia metody izolacji kwasów nukleinowych. Dobiera metodę identyfikacji markera genetycznego w zależności od rodzaju sekwencji nukleotydowej, typu polimorfizmu sekwencji.	BL_2A_W12, BL_2A_W03	P2A_W01, P2A_W02, P2A_W05, P2A_W06, P2A_W07	C-2	T-L-14, T-L-12, T-L-6, T-L-5, T-L-7, T-L-4, T-L-11, T-L-1, T-L-9, T-L-2, T-L-3, T-L-15, T-L-8, T-L-13, T-L-10	M-3	S-2

Zamierzone efekty kształcenia - umiejętności

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
BL_2A_BLM-S-B7_U04 Potrafi przeprowadzić preparatykę DNA/RNA z różnych tkanek. Interpretuje wyniki oceny ilościowej i jakościowej preparatów kwasów nukleinowych.	BL_2A_U06	P2A_U01, P2A_U03, P2A_U06	C-2	—	M-3	S-2
BL_2A_BLM-S-B7_U05 Potrafi przygotować mieszaninę reakcyjną do przeprowadzenia syntezy DNA in vitro, wykorzystywać enzymy restrykcyjne do identyfikacji substytucji pojedynczych nukleotydów. Potrafi posługiwać się techniką PCR do identyfikacji polimorfizmu DNA typu ins/del, analizy ekspresji genów.	BL_2A_U06, BL_2A_U11	P2A_U01, P2A_U02, P2A_U03, P2A_U04, P2A_U06	C-2, C-3	—	M-3	S-2
BL_2A_BLM-S-B7_U06 Interpretuje wyniki analizy SSCP. Umie przeprowadzić barwienie żeli PAA srebrem. Potrafi odczytać wyniki sekwencjonowania DNA.	BL_2A_U09	P2A_U01, P2A_U02, P2A_U04, P2A_U05	C-3	—	M-3	S-2

Zamierzone efekty kształcenia - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
BL_2A_BLM-S-B7_K01 Ma świadomość złożoności i różnorodności genomów.	BL_2A_K01	P2A_K04, P2A_K07	C-1	T-W-4, T-W-2, T-W-5, T-W-3, T-W-1	M-1	S-1

Kryterium oceny - wiedza

Efekt kształcenia	Ocena	Kryterium oceny
BL_2A_BLM-S-B7_W01 Definiuje typy markerów genetycznych.	2,0
	3,0	Student poprawnie definiuje wybrane typy markerów genetycznych
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0
BL_2A_BLM-S-B7_W02 Rozróżnia choroby genetyczne dziedziczone autosomalnie recesywnie i dominująco. Objaśnia mechanizmy genetycznej determinacji otłuszczenia, miognezy, starzenia się organizmu oraz zaburzeń determinacji płci.	2,0
	3,0	Student poprawnie definiuje najważniejsze różnice w typie dziedziczenia niektórych chorób. Objaśnia niektóre mechanizmy genetycznej determinacji różnych cech.
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0
BL_2A_BLM-S-B7_W03 Rozróżnia metody izolacji kwasów nukleinowych. Dobiera metodę identyfikacji markera genetycznego w zależności od rodzaju sekwencji nukleotydowej, typu polimorfizmu sekwencji.	2,0
	3,0	Student poprawnie wykorzystuje niektóre metody izolacji kwasów nukleinowych, dobiera odpowiedni typ markera genetycznego do zmiany w sekwencji.
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Kryterium oceny - umiejętności

Efekt kształcenia	Ocena	Kryterium oceny
BL_2A_BLM-S-B7_U04 Potrafi przeprowadzić preparatykę DNA/RNA z różnych tkanek. Interpretuje wyniki oceny ilościowej i jakościowej preparatów kwasów nukleinowych.	2,0
	3,0	Student poprawnie wykorzystuje niektóre narzędzia do preparatyki kwasów nukleinowych i ich oceny jakościowej/ ilościowej
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0
BL_2A_BLM-S-B7_U05 Potrafi przygotować mieszaninę reakcyjną do przeprowadzenia syntezy DNA in vitro, wykorzystywać enzymy restrykcyjne do identyfikacji substytucji pojedynczych nukleotydów. Potrafi posługiwać się techniką PCR do identyfikacji polimorfizmu DNA typu ins/del, analizy ekspresji genów.	2,0
	3,0	Student poprawnie wykorzystuje niektóre narzędzia do amplifikacji DNA in vitro oraz analizy zmienności w jego obrębie
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0
BL_2A_BLM-S-B7_U06 Interpretuje wyniki analizy SSCP. Umie przeprowadzić barwienie żeli PAA srebrem. Potrafi odczytać wyniki sekwencjonowania DNA.	2,0
	3,0	Student poprawnie interpretuje wyniki analizy SSCP, wykorzystuje odpowiednie oprogramowanie do odczytów wyników sekwencjonowania DNA
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Literatura podstawowa

Brown T.A., Genomy z CD-ROM, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2009
Słomski R. (red.), Analiza DNA teoria i praktyka, Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu, Poznań, 2011
Zwierzchowski L., Świtoński M., Genomika bydła i świń., Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu, Poznań, 2009

Literatura dodatkowa

Bal J., Biologia molekularna w medycynie. Elementy genetyki klinicznej., Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2008

Treści programowe - laboratoria

KOD	Treść programowa	Godziny
T-L-1	Zasady BHP w laboratorium. Obsługa urządzeń laboratoryjnych. Przygotowanie stanowisk do pracy.	2
T-L-2	Izolacja kwasów nukleinowych z różnych tkanek. Porównanie metod izolacji DNA.	2
T-L-3	Preparatyka RNA. Metody zabezpieczania RNA przed degradacją.	2
T-L-4	Jakościowa oraz ilościowa ocena preparatów kwasów nukleinowych.	2
T-L-5	Techniki wykorzystywane w identyfikacji markerów genetycznych. PCR, PCR-RFLP, PCR-ACRS cz.1	2
T-L-6	Techniki wykorzystywane w identyfikacji markerów genetycznych. PCR-indel, PCR-multipleks, LONG-PCR cz.2	2
T-L-7	Wykrywanie nieznanych mutacji w sekwencjach DNA. PCR-SSCP.Elektroforeza poliakrylamidowa. Barwienie DNA srebrem.	2
T-L-8	Diagnostyka chorób genetcznych. Polimorfizm indel genu PRNP owcy.	2
T-L-9	Markery molekularne płci. Ustalanie płci ssaków i ptaków.	2
T-L-10	Markery genetyczne otłuszczenia i umięśnienia. Polimorfizm genów leptyny i miostatyny.	2
T-L-11	Analiza ekspresji genów cz.1 RT-PCR, półilościowa ocena poziomu ekspresji genów.	2
T-L-12	Analiza ekspresji genów cz.2. real time-PCR, ilościowa ocena poziomu ekspresji genów.	2
T-L-13	Markery genetyczne w identyfikacji gatunkowej. Międzygatunkowa analiza sekwencjii mtDNA wybranych gatunków.	2
T-L-14	Markery genetyczne w identyfikacji osobniczej. Sekwencje powtórzone (STR, VNTR).	2
T-L-15	Analiza wyników sekwencjonowania DNA.	2
		30

Treści programowe - wykłady

KOD	Treść programowa	Godziny
T-W-1	Definicje markerów genetycznych. Organizacja genomu ssaków. Charakterystyka markerów klasy I i II oraz możliwości ich wykorzystania w analizie wybranych cech u ssaków. Markery cytogenetyczne.	2
T-W-2	Wykorzystanie martkerów molekularnych i cytogenetycznych w diagnostyce wad rozwojowych.	2
T-W-3	Markery genetyczne w prognozowaniu otłuszczenia u ssaków na modelu mysim.	2
T-W-4	Proces starzenia się - choroba genetyczna czy stan fizjologiczny? Progeria i przypadek Brooke Greenberg a merkery genetyczne starzenia się ssakówe.	2
T-W-5	Prosta definicja płci a złożony proces determinacji i różnicowania płciowego u ssków. Identyfikacja płci z wykorzystaniem markerów molekularnych.	2
		10

Formy aktywności - laboratoria

KOD	Forma aktywności	Godziny
A-L-1	Uczestnictwo w zajęciach laboratoryjnych.	30
A-L-2	Samodzielne poszerzanie wiedzy teoretycznej.	5
A-L-3	Przygotowanie do zaliczenia materiału.	10
		45

(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - wykłady

KOD	Forma aktywności	Godziny
A-W-1	Udział studenta w przeprowadzonych wykładach	10
A-W-2	Przygotowanie się do zaliczenia.	5
		15

(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BL_2A_BLM-S-B7_W01	Definiuje typy markerów genetycznych.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BL_2A_W12	ma zaawansowaną wiedzę na w zakresie funkcjonowania, ewolucji i analizy, w tym bioinformatycznej, genów i genomów, dziedziczenia genowego i pozagenowego oraz odpowiedzi genomu na czynniki występujące w środowisku
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P2A_W01	rozumie złożone zjawiska i procesy przyrodnicze
	P2A_W05	ma wiedzę w zakresie aktualnie dyskutowanych w literaturze kierunkowej problemów z wybranej dziedziny nauki i dyscypliny naukowej
	P2A_W07	ma wiedzę w zakresie zasad planowania badań z wykorzystaniem technik i narzędzi badawczych stosowanych w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
Cel przedmiotu	C-1	Celem przedmiotu jest zapoznanie studenta z markerami genetycznymi.
Treści programowe	T-W-1	Definicje markerów genetycznych. Organizacja genomu ssaków. Charakterystyka markerów klasy I i II oraz możliwości ich wykorzystania w analizie wybranych cech u ssaków. Markery cytogenetyczne.
Metody nauczania	M-1	Metody podające (wykład informacyjny, pogadanka, objaśnienie).
Sposób oceny	S-1	Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie wykładów.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Student poprawnie definiuje wybrane typy markerów genetycznych
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BL_2A_BLM-S-B7_W02	Rozróżnia choroby genetyczne dziedziczone autosomalnie recesywnie i dominująco. Objaśnia mechanizmy genetycznej determinacji otłuszczenia, miognezy, starzenia się organizmu oraz zaburzeń determinacji płci.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BL_2A_W12	ma zaawansowaną wiedzę na w zakresie funkcjonowania, ewolucji i analizy, w tym bioinformatycznej, genów i genomów, dziedziczenia genowego i pozagenowego oraz odpowiedzi genomu na czynniki występujące w środowisku
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BL_2A_W11	ma ogólną w niektórych obszarach pogłębioną wiedzę w zakresie funkcjonowania, morfologii i anatomii oraz aberracji wybranych narządów i układów organizmów żywych oraz procesów życiowych na różnych etapach rozwoju organizmu
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P2A_W01	rozumie złożone zjawiska i procesy przyrodnicze
	P2A_W04	ma pogłębioną wiedzę z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów umożliwiającą dostrzeganie związków i zależności w przyrodzie
	P2A_W05	ma wiedzę w zakresie aktualnie dyskutowanych w literaturze kierunkowej problemów z wybranej dziedziny nauki i dyscypliny naukowej
	P2A_W07	ma wiedzę w zakresie zasad planowania badań z wykorzystaniem technik i narzędzi badawczych stosowanych w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
Cel przedmiotu	C-3	Wskazanie sposobów poszukiwania nowych markerów genetycznych.
Treści programowe	T-W-5	Prosta definicja płci a złożony proces determinacji i różnicowania płciowego u ssków. Identyfikacja płci z wykorzystaniem markerów molekularnych.
	T-W-3	Markery genetyczne w prognozowaniu otłuszczenia u ssaków na modelu mysim.
	T-W-4	Proces starzenia się - choroba genetyczna czy stan fizjologiczny? Progeria i przypadek Brooke Greenberg a merkery genetyczne starzenia się ssakówe.
	T-W-2	Wykorzystanie martkerów molekularnych i cytogenetycznych w diagnostyce wad rozwojowych.
Metody nauczania	M-1	Metody podające (wykład informacyjny, pogadanka, objaśnienie).
Metody nauczania	M-2	Metody problemowe (wykład problemowy, wykład konwersatoryjny).
Sposób oceny	S-1	Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie wykładów.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Student poprawnie definiuje najważniejsze różnice w typie dziedziczenia niektórych chorób. Objaśnia niektóre mechanizmy genetycznej determinacji różnych cech.
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BL_2A_BLM-S-B7_W03	Rozróżnia metody izolacji kwasów nukleinowych. Dobiera metodę identyfikacji markera genetycznego w zależności od rodzaju sekwencji nukleotydowej, typu polimorfizmu sekwencji.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BL_2A_W12	ma zaawansowaną wiedzę na w zakresie funkcjonowania, ewolucji i analizy, w tym bioinformatycznej, genów i genomów, dziedziczenia genowego i pozagenowego oraz odpowiedzi genomu na czynniki występujące w środowisku
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BL_2A_W03	wykazuje się zaawansowaną znajomością metod, technik, technologii, narzędzi i materiałów pozwalających na badanie i wykorzystanie potencjału przyrody
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P2A_W01	rozumie złożone zjawiska i procesy przyrodnicze
	P2A_W02	konsekwentnie stosuje i upowszechnia zasadę ścisłego, opartego na danych empirycznych, interpretowania zjawisk i procesów przyrodniczych w pracy badawczej i działaniach praktycznych
	P2A_W05	ma wiedzę w zakresie aktualnie dyskutowanych w literaturze kierunkowej problemów z wybranej dziedziny nauki i dyscypliny naukowej
	P2A_W06	ma wiedzę w zakresie statystyki na poziomie prognozowania (modelowania) przebiegu zjawisk i procesów przyrodniczych oraz ma znajomość specjalistycznych narzędzi informatycznych
	P2A_W07	ma wiedzę w zakresie zasad planowania badań z wykorzystaniem technik i narzędzi badawczych stosowanych w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
Cel przedmiotu	C-2	Przybliżenie aktualnych metod molekularnych stosowanych w celu identyfikacji i analizy markerów genetycznych.
Treści programowe	T-L-14	Markery genetyczne w identyfikacji osobniczej. Sekwencje powtórzone (STR, VNTR).
	T-L-12	Analiza ekspresji genów cz.2. real time-PCR, ilościowa ocena poziomu ekspresji genów.
	T-L-6	Techniki wykorzystywane w identyfikacji markerów genetycznych. PCR-indel, PCR-multipleks, LONG-PCR cz.2
	T-L-5	Techniki wykorzystywane w identyfikacji markerów genetycznych. PCR, PCR-RFLP, PCR-ACRS cz.1
	T-L-7	Wykrywanie nieznanych mutacji w sekwencjach DNA. PCR-SSCP.Elektroforeza poliakrylamidowa. Barwienie DNA srebrem.
	T-L-4	Jakościowa oraz ilościowa ocena preparatów kwasów nukleinowych.
	T-L-11	Analiza ekspresji genów cz.1 RT-PCR, półilościowa ocena poziomu ekspresji genów.
	T-L-1	Zasady BHP w laboratorium. Obsługa urządzeń laboratoryjnych. Przygotowanie stanowisk do pracy.
	T-L-9	Markery molekularne płci. Ustalanie płci ssaków i ptaków.
	T-L-2	Izolacja kwasów nukleinowych z różnych tkanek. Porównanie metod izolacji DNA.
	T-L-3	Preparatyka RNA. Metody zabezpieczania RNA przed degradacją.
	T-L-15	Analiza wyników sekwencjonowania DNA.
	T-L-8	Diagnostyka chorób genetcznych. Polimorfizm indel genu PRNP owcy.
	T-L-13	Markery genetyczne w identyfikacji gatunkowej. Międzygatunkowa analiza sekwencjii mtDNA wybranych gatunków.
	T-L-10	Markery genetyczne otłuszczenia i umięśnienia. Polimorfizm genów leptyny i miostatyny.
Metody nauczania	M-3	Metody praktyczne (ćwiczenia laboratoryjne, metoda projektów).
Sposób oceny	S-2	Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Student poprawnie wykorzystuje niektóre metody izolacji kwasów nukleinowych, dobiera odpowiedni typ markera genetycznego do zmiany w sekwencji.
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BL_2A_BLM-S-B7_U04	Potrafi przeprowadzić preparatykę DNA/RNA z różnych tkanek. Interpretuje wyniki oceny ilościowej i jakościowej preparatów kwasów nukleinowych.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BL_2A_U06	potrafi przeprowadzać specjalistyczne prace eksperymentalne, potrafi stosować metody biologii i diagnostyki laboratoryjnej, potrafi wykonywać analizy laboratoryjne i posługiwać się sprzętem analitycznym i aparaturą badawczą, posiada umiejętność prowadzenia prac badawczych z użyciem materiału biologicznego, potrafi przeprowadzić badanie lub eksperyment z zastosowaniem zaawansowanych technik mikroskopowych
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P2A_U01	stosuje zaawansowane techniki i narzędzia badawcze w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	P2A_U03	wykazuje umiejętność krytycznej analizy i selekcji informacji, zwłaszcza ze źródeł elektronicznych
	P2A_U06	zbiera i interpretuje dane empiryczne oraz na tej podstawie formułuje odpowiednie wnioski
Cel przedmiotu	C-2	Przybliżenie aktualnych metod molekularnych stosowanych w celu identyfikacji i analizy markerów genetycznych.
Metody nauczania	M-3	Metody praktyczne (ćwiczenia laboratoryjne, metoda projektów).
Sposób oceny	S-2	Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Student poprawnie wykorzystuje niektóre narzędzia do preparatyki kwasów nukleinowych i ich oceny jakościowej/ ilościowej
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BL_2A_BLM-S-B7_U05	Potrafi przygotować mieszaninę reakcyjną do przeprowadzenia syntezy DNA in vitro, wykorzystywać enzymy restrykcyjne do identyfikacji substytucji pojedynczych nukleotydów. Potrafi posługiwać się techniką PCR do identyfikacji polimorfizmu DNA typu ins/del, analizy ekspresji genów.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BL_2A_U06	potrafi przeprowadzać specjalistyczne prace eksperymentalne, potrafi stosować metody biologii i diagnostyki laboratoryjnej, potrafi wykonywać analizy laboratoryjne i posługiwać się sprzętem analitycznym i aparaturą badawczą, posiada umiejętność prowadzenia prac badawczych z użyciem materiału biologicznego, potrafi przeprowadzić badanie lub eksperyment z zastosowaniem zaawansowanych technik mikroskopowych
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BL_2A_U11	wykorzystuje wiedzę z zakresu budowy i funkcji biologicznych białek, kwasów nukleinowych, węglowodanów, lipidów oraz hormonów i witamin; rozumie główne szlaki metaboliczne oraz mechanizmów regulacji metabolizmu, rozumie mechanizmy działania hormonów i ich rolę w organizmie;
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P2A_U01	stosuje zaawansowane techniki i narzędzia badawcze w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	P2A_U02	biegle wykorzystuje literaturę naukową z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów, w języku polskim; czyta ze zrozumieniem skomplikowane teksty naukowe w języku angielskim
	P2A_U03	wykazuje umiejętność krytycznej analizy i selekcji informacji, zwłaszcza ze źródeł elektronicznych
	P2A_U04	planuje i wykonuje zadania badawcze lub ekspertyzy pod kierunkiem opiekuna naukowego
	P2A_U06	zbiera i interpretuje dane empiryczne oraz na tej podstawie formułuje odpowiednie wnioski
Cel przedmiotu	C-2	Przybliżenie aktualnych metod molekularnych stosowanych w celu identyfikacji i analizy markerów genetycznych.
Cel przedmiotu	C-3	Wskazanie sposobów poszukiwania nowych markerów genetycznych.
Metody nauczania	M-3	Metody praktyczne (ćwiczenia laboratoryjne, metoda projektów).
Sposób oceny	S-2	Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Student poprawnie wykorzystuje niektóre narzędzia do amplifikacji DNA in vitro oraz analizy zmienności w jego obrębie
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BL_2A_BLM-S-B7_U06	Interpretuje wyniki analizy SSCP. Umie przeprowadzić barwienie żeli PAA srebrem. Potrafi odczytać wyniki sekwencjonowania DNA.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BL_2A_U09	potrafi wykorzystać techniki molekularne stosowane w taksonomii roślin, zwierząt i ludzi, rozumie budowę i funkcje genomu organizmów eukariotycznych oraz procesy dziedziczenia, wykorzystuje metody biologii molekularnej;
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P2A_U01	stosuje zaawansowane techniki i narzędzia badawcze w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	P2A_U02	biegle wykorzystuje literaturę naukową z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów, w języku polskim; czyta ze zrozumieniem skomplikowane teksty naukowe w języku angielskim
	P2A_U04	planuje i wykonuje zadania badawcze lub ekspertyzy pod kierunkiem opiekuna naukowego
	P2A_U05	stosuje metody statystyczne oraz techniki i narzędzia informatyczne do opisu zjawisk i analizy danych o charakterze specjalistycznym
Cel przedmiotu	C-3	Wskazanie sposobów poszukiwania nowych markerów genetycznych.
Metody nauczania	M-3	Metody praktyczne (ćwiczenia laboratoryjne, metoda projektów).
Sposób oceny	S-2	Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Student poprawnie interpretuje wyniki analizy SSCP, wykorzystuje odpowiednie oprogramowanie do odczytów wyników sekwencjonowania DNA
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BL_2A_BLM-S-B7_K01	Ma świadomość złożoności i różnorodności genomów.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BL_2A_K01	wykazuje zrozumienie i przekonanie o poznawalności procesów i zjawisk biologicznych zachodzących w świecie żywych organizmów; w interpretowaniu procesów i zjawisk biologicznych wykorzystuje podejście naukowe
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P2A_K04	prawidłowo identyfikuje i rozstrzyga dylematy związane z wykonywaniem zawodu
	P2A_K07	systematycznie aktualizuje wiedzę przyrodniczą i zna jej praktyczne zastosowania
Cel przedmiotu	C-1	Celem przedmiotu jest zapoznanie studenta z markerami genetycznymi.
Treści programowe	T-W-4	Proces starzenia się - choroba genetyczna czy stan fizjologiczny? Progeria i przypadek Brooke Greenberg a merkery genetyczne starzenia się ssakówe.
	T-W-2	Wykorzystanie martkerów molekularnych i cytogenetycznych w diagnostyce wad rozwojowych.
	T-W-5	Prosta definicja płci a złożony proces determinacji i różnicowania płciowego u ssków. Identyfikacja płci z wykorzystaniem markerów molekularnych.
	T-W-3	Markery genetyczne w prognozowaniu otłuszczenia u ssaków na modelu mysim.
	T-W-1	Definicje markerów genetycznych. Organizacja genomu ssaków. Charakterystyka markerów klasy I i II oraz możliwości ich wykorzystania w analizie wybranych cech u ssaków. Markery cytogenetyczne.
Metody nauczania	M-1	Metody podające (wykład informacyjny, pogadanka, objaśnienie).
Sposób oceny	S-1	Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie wykładów.