Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Biotechnologia (S2)
specjalność: Biotechnologia w produkcji roślinnej
Sylabus przedmiotu Inżynieria enzymowa:
Informacje podstawowe
| Kierunek studiów | Biotechnologia | ||
|---|---|---|---|
| Forma studiów | studia stacjonarne | Poziom | drugiego stopnia |
| Tytuł zawodowy absolwenta | magister inżynier | ||
| Obszary studiów | nauk rolniczych, leśnych i weterynaryjnych, studiów inżynierskich | ||
| Profil | ogólnoakademicki | ||
| Moduł | — | ||
| Przedmiot | Inżynieria enzymowa | ||
| Specjalność | Biotechnologia w produkcji zwierzęcej i ochronie środowiska | ||
| Jednostka prowadząca | Katedra Immunologii, Mikrobiologii i Chemii Fizjologicznej | ||
| Nauczyciel odpowiedzialny | Radosław Drozd <Radoslaw.Drozd@zut.edu.pl> | ||
| Inni nauczyciele | |||
| ECTS (planowane) | 4,0 | ECTS (formy) | 4,0 |
| Forma zaliczenia | egzamin | Język | polski |
| Blok obieralny | — | Grupa obieralna | — |
Formy dydaktyczne
Wymagania wstępne
| KOD | Wymaganie wstępne |
|---|---|
| W-1 | Znajomość podstaw chemii organicznej i nieorganiczej, biochemii, biofizyki, chemii fizycznej, jezyka angielskiego w stopniu średnio zaawansowanym |
Cele przedmiotu
| KOD | Cel modułu/przedmiotu |
|---|---|
| C-1 | Zapoznanie studenta z podstawami inzynieri białek katalitycznych |
| C-2 | Zapoznanie z metodami in silico predykcji struktur białkowych |
| C-3 | Wyuczenie umiejetności doboru odpowiednich metod służących do immobilizacji białek enzymowych |
Treści programowe z podziałem na formy zajęć
| KOD | Treść programowa | Godziny |
|---|---|---|
| ćwiczenia audytoryjne | ||
| T-A-1 | Znaczenie użytkowe enzymów z klasy oksodoreduktaz | 2 |
| T-A-2 | Znaczenie użytkowe enzymów z klasy transferaz | 2 |
| T-A-3 | Znaczenie użytkowe enzymów z klasy hydrolaz | 2 |
| T-A-4 | Znaczenie użytkowe enzymów z klasy liaz | 2 |
| T-A-5 | Znaczenie użytkowe enzymów z klasy izomeraz | 2 |
| T-A-6 | Znaczenie użytkowe enzymów z klasy ligaz | 2 |
| T-A-7 | Optymazlizacja aktywności enzymów w procesach technologicznych | 3 |
| 15 | ||
| laboratoria | ||
| T-L-1 | Metody wizualizacji struktur biąłkowych z wykorzystaniem specjalistycznego oprogramowania | 2 |
| T-L-2 | Metody komputerowe rozwiązywania struktury II i III rzedu białek | 4 |
| T-L-3 | Modelowanie parametrów kinetycznych enzymów | 2 |
| T-L-4 | Oczyszczanie białek enzymatycznych | 2 |
| T-L-5 | Immobiizacja enzymów na matrycach organicznych i nieoragniacznych | 5 |
| 15 | ||
| wykłady | ||
| T-W-1 | Funkcja i znaczenie struktury enzymów. Oddziaływania stabilizujące budowę białek enzymatycznych. Sposoby analizy struktury pierwszorzędowej białek enzymatycznych. Oddziaływania stabilizujące budowę białek. Sposoby analizy struktury drugorzędowej i trzeciorzędowej białek enzymatycznych | 2 |
| T-W-2 | Metody przeszukiwania sekwencyjnych i strukturalnych białkowych baz danych. Programy, praktyczne podejście do porównywania struktury I, II i III rzędu enzymów. Metody rozwiązywania struktury 3D enzymów. Metody klasyczne (X-ray, NMR) vs modelowanie porównawcze i metody ab-initio | 2 |
| T-W-3 | Właściwości katalityczne enzymów a metody in-vitro badania ich grup czynnych | 2 |
| T-W-4 | Modelowanie i optymalizacja parametrów kinetycznych enzymów. Przewidywanie i projektowanie in-silico właściwości katalitycznych enzymów | 2 |
| T-W-5 | Metody stabilizacji i immobilizacji enzymów. Izolacja, oczyszczanie i frakcjonowanie enzymów | 2 |
| T-W-6 | Mikrobiologiczna produkcja preparatów enzymatycznych. Rodzaje procesów fermentacyjnych. Projektowanie i optymalizacja bioreaktorów do produkcji enzymów na skalę przemysłową | 2 |
| T-W-7 | Enzymy w przemyśle spożywczym i farmaceutycznym. Enzymy w przemyśle tekstylnym i materiałowym | 2 |
| T-W-8 | Enzymy stosowane w remediacji środowiska i produkcji paliw ze źródeł odnawialnych. Enzymy stosowane w gospodarstwie domowym | 1 |
| 15 | ||
Obciążenie pracą studenta - formy aktywności
| KOD | Forma aktywności | Godziny |
|---|---|---|
| ćwiczenia audytoryjne | ||
| A-A-1 | uczestnictow w zajęciach | 15 |
| A-A-2 | przygotowanie do zajeć | 10 |
| A-A-3 | czytanie wskazanej literatury | 5 |
| A-A-4 | uczestictow w zjęciach | 20 |
| A-A-5 | przygotowanie do kolokwium | 20 |
| A-A-6 | czytanie wskazanej literatury | 10 |
| A-A-7 | godziny kontaktowe | 10 |
| 90 | ||
| laboratoria | ||
| A-L-1 | uczestnictow w zajęciach | 15 |
| A-L-2 | przygotowaie sprawozdania z laboratoriów | 5 |
| A-L-3 | przygotowanie do zajęc laboratoryjnych | 10 |
| A-L-4 | uczestnisctow zajęciach | 20 |
| A-L-5 | przygotowanie sprawozdań z zajęc laboratoryjnych | 30 |
| A-L-6 | czytanie wskazanej literatury | 10 |
| 90 | ||
| wykłady | ||
| A-W-1 | przygotowanie do egzaminu | 20 |
| A-W-2 | uczestnictwo w zajęciach | 20 |
| A-W-3 | czytanie wskazanej literatury | 10 |
| A-W-4 | przygotowanie do zajęc | 10 |
| A-W-5 | godziny kontaktowe | 20 |
| 80 | ||
Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne
| KOD | Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne |
|---|---|
| M-1 | wykład informacyjny |
| M-2 | opowiadanie |
| M-3 | anegdota |
| M-4 | wykład konwersatoryjny |
Sposoby oceny
| KOD | Sposób oceny |
|---|---|
| S-1 | Ocena podsumowująca: Egzamin pisemny, test |
| S-2 | Ocena formująca: Konspekt z zajęc laboratoryjnych Wejsciówka Prezentacja multimedialna |
Zamierzone efekty kształcenia - wiedza
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BT_2A_BTZ-S-D8_W01 Posiada wiedzę zakresu strukturalnych zależności kształtujących własciwości katalityczne enzymów. Zna narzędzia kinforamtyczne pozwalające na przewidywanie struktury enzymów. | BT_2A_W09 | R2A_W05 | InzA2_W01, InzA2_W05 | C-2, C-3, C-1 | T-L-2, T-L-3 | M-2, M-3, M-4, M-1 | S-1, S-2 |
| BT_2A_BTZ-S-D8_W02 Zna metody immobilizacji enzymów, sposoby przygotowania wysokooczyszczonych preparatów enzymatycznych. | BT_2A_W09 | R2A_W05 | InzA2_W01, InzA2_W05 | C-1, C-3, C-2 | T-W-5, T-L-4, T-L-5, T-W-1, T-W-4 | M-2, M-3, M-4, M-1 | S-2, S-1 |
| BT_2A_BTZ-S-D8_W03 Zna sposoby selekcji mikroorganizmów do zadań aplikacyjnych mających na celu produkcję nzymó o określonej aktywności katalitycznej | BT_2A_W09 | R2A_W05 | InzA2_W01, InzA2_W05 | C-3, C-1, C-2 | T-A-3, T-A-1, T-A-7, T-A-4, T-L-5, T-A-2, T-W-8, T-A-5, T-W-6, T-A-6, T-W-5 | M-1, M-4, M-3, M-2 | S-1, S-2 |
Zamierzone efekty kształcenia - umiejętności
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BT_2A_BTZ-S-D8_U01 Korzysta z narzedzi bioinformatycznych do rozwioażywania struktury enzymów, potrafi poszukiwać zależnosci między ich strukturą a funkcjami katalitycznymi | BT_2A_U07 | R2A_U01, R2A_U03, R2A_U04, R2A_U05, R2A_U06, R2A_U07 | InzA2_U03 | C-1, C-3, C-2 | T-L-2, T-W-5, T-W-4, T-L-3, T-L-1 | M-3, M-4, M-2, M-1 | S-2 |
| BT_2A_BTZ-S-D8_U02 Analizuje metody pozwalające na unieczynianie enzymów, kalkuluje możliwości ich zastosowania w konkretnych aplikacjach | BT_2A_U07 | R2A_U01, R2A_U03, R2A_U04, R2A_U05, R2A_U06, R2A_U07 | InzA2_U03 | C-2, C-1, C-3 | T-W-4, T-W-7, T-L-5, T-W-6, T-W-5, T-A-7 | M-1, M-3, M-4, M-2 | S-2, S-1 |
Zamierzone efekty kształcenia - inne kompetencje społeczne i personalne
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BT_2A_BTZ-S-D8_K01 Zna i wykorzystuje metody biotechnologiczne do polepsznaia jakości życia swojego i innych | BT_2A_K02, BT_2A_K03, BT_2A_K04 | R2A_K02, R2A_K03, R2A_K04, R2A_K05, R2A_K06 | InzA2_K01 | C-3, C-1, C-2 | T-W-8, T-A-7 | M-4, M-3, M-2, M-1 | S-2, S-1 |
Kryterium oceny - wiedza
| Efekt kształcenia | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| BT_2A_BTZ-S-D8_W01 Posiada wiedzę zakresu strukturalnych zależności kształtujących własciwości katalityczne enzymów. Zna narzędzia kinforamtyczne pozwalające na przewidywanie struktury enzymów. | 2,0 | |
| 3,0 | Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 | ||
| BT_2A_BTZ-S-D8_W02 Zna metody immobilizacji enzymów, sposoby przygotowania wysokooczyszczonych preparatów enzymatycznych. | 2,0 | |
| 3,0 | Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 | ||
| BT_2A_BTZ-S-D8_W03 Zna sposoby selekcji mikroorganizmów do zadań aplikacyjnych mających na celu produkcję nzymó o określonej aktywności katalitycznej | 2,0 | |
| 3,0 | Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Kryterium oceny - umiejętności
| Efekt kształcenia | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| BT_2A_BTZ-S-D8_U01 Korzysta z narzedzi bioinformatycznych do rozwioażywania struktury enzymów, potrafi poszukiwać zależnosci między ich strukturą a funkcjami katalitycznymi | 2,0 | |
| 3,0 | Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 | ||
| BT_2A_BTZ-S-D8_U02 Analizuje metody pozwalające na unieczynianie enzymów, kalkuluje możliwości ich zastosowania w konkretnych aplikacjach | 2,0 | |
| 3,0 | Przygotowanie prezentacji multimedialnej, uczestnictwo w 90 % zajęć audytoryjnych, Poprawna odpowiedz na 60 % pytań testowych - egzamin | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne
| Efekt kształcenia | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| BT_2A_BTZ-S-D8_K01 Zna i wykorzystuje metody biotechnologiczne do polepsznaia jakości życia swojego i innych | 2,0 | |
| 3,0 | uczestnictwo w zajęciach | |
| 3,5 | poprawne wykonywanie poleceń prowadzącego, uczestnictwo w zajęcaich | |
| 4,0 | wykonanie konspektu z zajęc laboratoryjnych, poprawne wykonywanie poleceń prowadzącego, uczestnictwo w zajęcaich | |
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Literatura podstawowa
- Jerzy Witwicki, Elementy enzymologii, PWN, Warszawa, 1984
- David Hawcroft, Diagnostic enzymology, ACOL, Londyn, 1986
- Wolfgang Aehle red., Enzymes in Industry: Production and Applications, Willey VCH, 2007, III
- Allan Svendsen, Enzyme Functionality: Design, Engineering and Screening, 2004
- Christoph Wittmann i Rainer Krull red., Biosystems Engineering I: Creating Superior Biocatalysts, Tom 1, Springer, 2010
- Girish Shukla i Ajit Varma, Soil Enzymology, Springer, 2011
Literatura dodatkowa
- Athel Cornish-Bowden, Fundamentals of Enzyme Kinetics, Portland Press, Londyn, 2002, III