Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Biotechnologia (S2)
Sylabus przedmiotu Genomika roślin:
Informacje podstawowe
| Kierunek studiów | Biotechnologia | ||
|---|---|---|---|
| Forma studiów | studia stacjonarne | Poziom | drugiego stopnia |
| Tytuł zawodowy absolwenta | magister inżynier | ||
| Obszary studiów | nauk rolniczych, leśnych i weterynaryjnych, studiów inżynierskich | ||
| Profil | ogólnoakademicki | ||
| Moduł | — | ||
| Przedmiot | Genomika roślin | ||
| Specjalność | Biotechnologia w produkcji roślinnej | ||
| Jednostka prowadząca | Katedra Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin | ||
| Nauczyciel odpowiedzialny | Piotr Masojć <Piotr.Masojc@zut.edu.pl> | ||
| Inni nauczyciele | Beata Myśków <Beata.Myskow@zut.edu.pl> | ||
| ECTS (planowane) | 3,0 | ECTS (formy) | 3,0 |
| Forma zaliczenia | zaliczenie | Język | polski |
| Blok obieralny | — | Grupa obieralna | — |
Formy dydaktyczne
Wymagania wstępne
| KOD | Wymaganie wstępne |
|---|---|
| W-1 | genetyka ogólna |
| W-2 | biologia molekularna |
Cele przedmiotu
| KOD | Cel modułu/przedmiotu |
|---|---|
| C-1 | wyjaśnienie metodologii i osiągnięć współczesnej genomiki roślin |
Treści programowe z podziałem na formy zajęć
| KOD | Treść programowa | Godziny |
|---|---|---|
| ćwiczenia audytoryjne | ||
| T-A-1 | Porównanie map genetycznych genomów zbóż | 2 |
| T-A-2 | Porównanie sekwencji genomów odrębnych geograficznie linii ogórka | 2 |
| T-A-3 | Analiza architektury genomowej cech użytkowych roślin uprawnych | 3 |
| T-A-4 | Zasady konstruowania mikromacierzy DNA | 2 |
| T-A-5 | Przykłady wykorzystania mikromacierzy DNA w analizie genomów roślin | 2 |
| T-A-6 | Zasady konstruowania mikromacierzy na bazie cDNA | 2 |
| T-A-7 | Przykłady wykorzystania mikromacierzy na bazie sekwencji cDNA w analizie ekspresji genów | 2 |
| 15 | ||
| wykłady | ||
| T-W-1 | Struktura i wielkość genomów Arabidopsis, ryżu, ogórka jako roślin modelowych | 1 |
| T-W-2 | Kolinearność genomów traw i jej konsekwencje dla metodologii badań | 1 |
| T-W-3 | Rozmieszczenie genów w genomach traw na podstawie skonstruowanych map genetycznych | 1 |
| T-W-4 | Wielość kopii genu w genomie i obecność rodzin wielogenowych | 1 |
| T-W-5 | Architektura genomowa cech mierzalnych na podstawie analizy QTL | 1 |
| T-W-6 | Architektura genomowa cech mierzalnych na podstawie analizy metodą BSG | 1 |
| T-W-7 | Plastyczność genomów roślinnych w warunkach krzyżowań oddalonych i w kulturach in vitro | 1 |
| T-W-8 | Globalne zmiany ekspresji genów w odpowiedzi na stres suszy, zasolenia i chłodu | 1 |
| T-W-9 | Linie introgresywne jako narzędzie badania genomów roślin | 1 |
| T-W-10 | Zmiany ekspresji genów w fazach rozwojowych roślin | 1 |
| T-W-11 | Ekspresja genów związana z odpornością na porastanie żyta | 1 |
| T-W-12 | Zmiany genomowe ekspresji genów pod wpływem transformacji roślin | 1 |
| T-W-13 | Zmiany ekspresji genów związane z tolerancją roślin na niedobory pokarmowe | 1 |
| T-W-14 | Zmiany ekspresji genów pod wpływem herbicydów | 1 |
| T-W-15 | Genomika szlaków metabolicznych | 1 |
| 15 | ||
Obciążenie pracą studenta - formy aktywności
| KOD | Forma aktywności | Godziny |
|---|---|---|
| ćwiczenia audytoryjne | ||
| A-A-1 | Uczestnictwo w zajęciach | 15 |
| A-A-2 | Opracowanie zagadnień z wybranych publikacji naukowych w formie referatu | 15 |
| A-A-3 | praca własna z literaturą naukową na temat zagadnień omawianych na ćwiczeniach | 12 |
| A-A-4 | zaliczenie ćwiczeń | 3 |
| 45 | ||
| wykłady | ||
| A-W-1 | Uczestnictwo w wykładach | 15 |
| A-W-2 | Samodzielna praca studenta na bazie podręcznika, notatek z wykładów | 16 |
| A-W-3 | Przygotowanie do zaliczenia | 12 |
| A-W-4 | Zaliczenie wykładów | 2 |
| 45 | ||
Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne
| KOD | Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne |
|---|---|
| M-1 | wykład informacyjny |
| M-2 | prezentacje multimedialne z użyciem komputera i rzutnika |
| M-3 | metoda aktywizacyjna: student opracowuje i przedstawiw na forum grupy referat na bazie przestudiowania oryginalnych angielskojęzycznych publikacjach naukowych ilustrujących zagadnienia poruszane na ćwiczeniach |
Sposoby oceny
| KOD | Sposób oceny |
|---|---|
| S-1 | Ocena podsumowująca: Test pisemny złożony z 15 pytań szczegółowych z zakresu wiedzy podanej na wykładach |
| S-2 | Ocena podsumowująca: ocena referatu prezentowanego przez studenta na ćwiczeniach |
| S-3 | Ocena podsumowująca: Test pisemny z zakresu wiedzy omawianej na ćwiczeniach |
Zamierzone efekty kształcenia - wiedza
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BT_2A_BTR-S-C5_W01 student potrafi opisać metody genomiki roślin i podać przykłady ich zastosowań w badaniach nad genomami roślin | BT_2A_W07 | R2A_W03, R2A_W06 | — | C-1 | T-W-9, T-W-10, T-W-11, T-W-12, T-W-13, T-W-14, T-W-15, T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-5, T-W-6, T-W-4, T-W-7, T-W-8, T-A-1, T-A-5, T-A-6, T-A-2, T-A-4, T-A-7, T-A-3 | M-1, M-2, M-3 | S-3, S-1, S-2 |
Zamierzone efekty kształcenia - umiejętności
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BT_2A_BTR-S-C5_U01 posiada umiejętność analizowania i prezentowania metod i wyników współczesnych publikacji oryginalnych z zakresu genomiki roślin | BT_2A_U06 | R2A_U01, R2A_U04, R2A_U05, R2A_U06, R2A_U07 | InzA2_U02, InzA2_U06 | C-1 | T-A-1, T-A-5, T-A-6, T-A-2, T-A-4, T-A-7, T-A-3 | M-2 | S-2 |
Zamierzone efekty kształcenia - inne kompetencje społeczne i personalne
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BT_2A_BTR-S-C5_K01 ma świadomość możliwości analitycznych współczesnych metod genomiki | BT_2A_K02 | R2A_K04, R2A_K05 | InzA2_K01 | C-1 | T-W-9, T-W-10, T-W-11, T-W-12, T-W-13, T-W-14, T-W-15, T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-5, T-W-6, T-W-4, T-W-7, T-W-8, T-A-1, T-A-5, T-A-6, T-A-2, T-A-4, T-A-7, T-A-3 | M-2, M-3 | S-3, S-2 |
Kryterium oceny - wiedza
| Efekt kształcenia | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| BT_2A_BTR-S-C5_W01 student potrafi opisać metody genomiki roślin i podać przykłady ich zastosowań w badaniach nad genomami roślin | 2,0 | student wykazuje brak wiedzy na temat metod genomiki roślin i przykładów jej analizy |
| 3,0 | student wykazuje podstawową wiedzę na temat metod genomiki roślin i zna jakiekolwiek przykłady ich zastosowań | |
| 3,5 | student wykazuje podstawową wiedzę na temat metod genomiki roślin i podaje kilka przykładów wykorzystania tych metod w badaniach genomicznych roślin | |
| 4,0 | student ma wiedzę na temat większości metod genomiki roslin omawianych na zajęciach i większości omawianych zastosowań | |
| 4,5 | student ma wiedzę na temat wszystkich metod genomiki roślin omawianych na zajęciach i większości omawianych zastosowań | |
| 5,0 | student ma dogłębna wiedzę na temat metod genomiki roślin i wszystkich omawianych zastosowań |
Kryterium oceny - umiejętności
| Efekt kształcenia | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| BT_2A_BTR-S-C5_U01 posiada umiejętność analizowania i prezentowania metod i wyników współczesnych publikacji oryginalnych z zakresu genomiki roślin | 2,0 | Nie umie zaprezentować metod i wyników badań z oryginalnych publikacji naukowych z dziedziny genomiki |
| 3,0 | umie prezentować wybrane metody i wyniki z publikacji naukowych z dziedziny genomiki roślin | |
| 3,5 | umie prezentować większość metod i wyników badań z publikacji z dziedziny genomiki roślin | |
| 4,0 | potrafi prezentować i dyskutować metody i wyniki badań z publikacji z dziedziny genomiki roślin | |
| 4,5 | potrafi samodzielnie interpretować wyniki i metody badań z publikacji z dziedziny genomiki roślin | |
| 5,0 | potrafi przedstawić i krytycznie odnieść się do wyników i metod prezentowanych w publikacjach naukowych z dziedziny genomiki roślin |
Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne
| Efekt kształcenia | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| BT_2A_BTR-S-C5_K01 ma świadomość możliwości analitycznych współczesnych metod genomiki | 2,0 | nie ma świadomości możliwości analitycznych współczesnych metod genomiki roślin |
| 3,0 | wykazuje świadomość mozliwości analitycznych wybranych metod genomiki roslin | |
| 3,5 | wykazuje świadomośc mozliwości analitycznych wielu metod genomiki roślin | |
| 4,0 | wykazuje świadomość możliwości analitycznych większości metod genomiki roślin | |
| 4,5 | wykazuje świadomość możliwości analitycznych wszystkich omawianych metod genomiki roślin | |
| 5,0 | ma świadomość możliwości analitycznych wszystkich omawianych metod genomiki roślin i ich przydatności w rozwiązywaniu konkretnych problemów badawczych |
Literatura podstawowa
- T.A. Brown, Genomy, Wydawnictwo naukowe PWN, Warszawa, 2009
Literatura dodatkowa
- Zespoły badawcze z całego świata, Bieżące publikacje naukowe oryginalnych prac z dziedziny genomiki roślin, różne, czasopisma angielskojęzyczne, 2011