ZUT - Krajowe Ramy Kwalifikacji / Rok 2017/2018 / Wydział Nauk o Żywności i Rybactwa / Zarządzanie bezpieczeństwem i jakością żywności (S1) / Sylabus przedmiotu - Techniki biologii molekularnej w analizie żywności

Wydział Nauk o Żywności i Rybactwa - Zarządzanie bezpieczeństwem i jakością żywności (S1)

Sylabus przedmiotu Techniki biologii molekularnej w analizie żywności:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów	Zarządzanie bezpieczeństwem i jakością żywności
Forma studiów	studia stacjonarne	Poziom	pierwszego stopnia
Tytuł zawodowy absolwenta	inżynier
Obszary studiów	nauki rolnicze, leśne i weterynaryjne, studia inżynierskie
Profil	ogólnoakademicki
Moduł	—
Przedmiot	Techniki biologii molekularnej w analizie żywności
Specjalność	przedmiot wspólny
Jednostka prowadząca	Katedra Mikrobiologii Stosowanej i Fizjologii Żywienia Człowieka
Nauczyciel odpowiedzialny	Wojciech Sawicki <Wojciech.Sawicki@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele
ECTS (planowane)	4,0	ECTS (formy)	4,0
Forma zaliczenia	zaliczenie	Język	polski
Blok obieralny	11	Grupa obieralna	2

Formy dydaktyczne

Forma dydaktyczna	KOD	Semestr	Godziny	ECTS	Waga	Zaliczenie
wykłady	W	5	30	2,0	0,50	zaliczenie
laboratoria	L	5	15	2,0	0,50	zaliczenie

Wymagania wstępne

KOD	Wymaganie wstępne
W-1	Biochemia,

Cele przedmiotu

KOD	Cel modułu/przedmiotu
C-1	Celem przedmiotu jest przedstawienie i praktyczne zapoznanie się studentów z metodami biologii molekularnej stosowanych w badaniu produktów spożywczych, w szczególności metod opierających się na technice PCR, zasad wykonywania oznaczeń, interpretacji wyników, zalet a także ograniczeń stosowania technik bazujących na amplifikacji DNA

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KOD	Treść programowa	Godziny
laboratoria
T-L-1	Izolacja DNA z komórek bakteryjnych, grzybowych oraz z materiału pochodzenia roślinnego i zwierzęcego	8
T-L-2	Praktyczne wykorzystanie reakcji PCR do wykrywania wybranych patogenów w żywności oraz do identyfikacji składu surowcowego produktów mięsnych	7
		15
wykłady
T-W-1	Rozwój metod analizy kwasów nukleinowych	2
T-W-2	Budowa genu eukariotycznego i współczesna definicja genu.	2
T-W-3	Polimorfizm genetyczny i markery molekularne	2
T-W-4	Metody i techniki molekularne wykorzystywane w analizie żywności - Reakcja łańcuchowa polimerazy i jej odmiany - Elektroforeza żelowa - Sekwencjonowanie kwasów nukleinowych - Hybrydyzacja in situ - Mikromacierze DNA	15
T-W-5	Wykorzystanie enzymów restrykcyjnych w analizie żywności	4
T-W-6	Kody kreskowe organizmów żywych (DNA barcoding) i metabarcoding (DNA barcoding z prób środowiskowych).	3
T-W-7	Autentyczność i identyfikowalność żywności	2
		30

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KOD	Forma aktywności	Godziny
laboratoria
A-L-1	uczestnictwo w zajęciach	15
A-L-2	przygotowanie do pracy w podgrupach	35
A-L-3	przygotowanie się do zaliczenia ćwiczeńlaboratoryjnych	10
		60
wykłady
A-W-1	uczestnictwo w zajęciach	30
A-W-2	Studiowanie literatury przedmiotu i przygotowanie się do zaliczenia przedmiotu	30
		60

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KOD	Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1	Wykład informacyjny prezentujący zagadnienia teoretyczne
M-2	Ćwiczenia laboratoryjne

Sposoby oceny

KOD	Sposób oceny
S-1	Ocena formująca: Bieżąca kontrola przygotowania się i poprawności pracy na zajęciach laboratoryjnych
S-2	Ocena podsumowująca: Test pisemny, uwzględniający cały zakres materiału omawainy na wykładach i zajęciach laboratoryjnych

Zamierzone efekty kształcenia - wiedza

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
ZBJZ_1A_PO7-13_W01 Student posiada wiedzę dotyczacą współczesnych metod biologii molekularnej stosowanych w lanalizie żywności	ZBJZ_1A_W14	—	—	C-1	T-W-1, T-W-5, T-W-3, T-W-4, T-W-6, T-W-2, T-W-7, T-L-1, T-L-2	M-1, M-2	S-2

Zamierzone efekty kształcenia - umiejętności

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
ZBJZ_1A_PO7-13_U01 Student potrafi praktycznie wykorzystać poznane techniki biologii molekularnej w analizie żywności	ZBJZ_1A_U02, ZBJZ_1A_U13	—	—	C-1	T-W-4, T-L-1, T-L-2	M-2	S-1

Zamierzone efekty kształcenia - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
ZBJZ_1A_PO7-13_K01 Posiada kompetencje oparte na wiedzy i umiejętnościach pozwalające na samodzielne przeprowadzanie analiz żywności technikami biologii molekularnej	ZBJZ_1A_K01, ZBJZ_1A_K04	—	—	C-1	T-W-1, T-W-5, T-W-3, T-W-4, T-W-6, T-W-2, T-W-7, T-L-1, T-L-2	M-1, M-2	S-1

Kryterium oceny - wiedza

Efekt kształcenia	Ocena	Kryterium oceny
ZBJZ_1A_PO7-13_W01 Student posiada wiedzę dotyczacą współczesnych metod biologii molekularnej stosowanych w lanalizie żywności	2,0	Student nie potrafi w najprostszy sposób zaprezentować swojej wiedzy
	3,0	Student prezentuje "suche" wyniki bez umiejętności ich efektywnej analizy.
	3,5	Student prezentuje wyniki z umiejętności ich efektywnej analizy.
	4,0	Student nie tylko efektywnie prezentuje wyniki, ale również dokonuje ich analizy. Potrafi również prowadzić dyskusję o osiągniętych wynikach.
	4,5	Student potrafi efektywnie prezentować, analizować, dyskutować o osiągniętych wynikach oraz oszacować błędy.
	5,0	Student potrafi efektywnie prezentować, analizować, dyskutować o osiągniętych wynikach, a także proponować modyfikacje w układzie pomiarowym.

Kryterium oceny - umiejętności

Efekt kształcenia	Ocena	Kryterium oceny
ZBJZ_1A_PO7-13_U01 Student potrafi praktycznie wykorzystać poznane techniki biologii molekularnej w analizie żywności	2,0	Student nie potrafi zidentyfikować i poradzić sobie samodzielnie z trudnościami mogącymi pojawić się na każdym z etapów pracy, nie operuje wiedzą kontekstową
	3,0	Student potrafi zidentyfikować i poradzić sobie, z nieznaczną pomocą nauczyciela, z wybranymi trudnościami związanymi z procesem przygotowania zleconej pracy
	3,5	Student potrafi zidentyfikować i samodzielnie radzi sobie z podstawowymi trudnościami związanymi z procesem przygotowania zleconej pracy
	4,0	Student potrafi samodzielnie zidentyfikować i radzi sobie z podstawowymi trudnościami związanymi z procesem przygotowania własnego przedsięwzięcia
	4,5	Student samodzielnie identyfikuje i rozwiązuje trudności związane z procesem przygotowania własnego przedsięwzięcia
	5,0	Student samodzielnie identyfikuje i rozwiązuje trudności związane z procesem przygotowania własnego przedsięwzięcia,dzieki posiadanej wiedzy i umiejetnością wykazuje się własną inicjatywą.

Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne

Efekt kształcenia	Ocena	Kryterium oceny
ZBJZ_1A_PO7-13_K01 Posiada kompetencje oparte na wiedzy i umiejętnościach pozwalające na samodzielne przeprowadzanie analiz żywności technikami biologii molekularnej	2,0	Nie wykazuje potrzeby uzupełniania wiedzy z zakresu biologii molekularnej
	3,0	Ma znikomą świadomość znaczenia ciągłego uzupełniania wiedzy z zakresu biologii molekularnej dla efektywności realizacji powierzonych zadań.
	3,5	Dostrzega w średnim stopniu potrzebę stosowania zdobytej wiedzy w praktyce i poszerzenia zakresu zdobytych informacji
	4,0	Wykazuje w stopniu dobrym dbałość o właściwą realizację powierzonych zadań.
	4,5	Ma dobrą świadomość zagrożenia i posiada dobrą zdolność oceny sytuacji i wykorzystania własnej wiedzy i umiejetności w realizowaniu powierzonych zadań.
	5,0	Może być liderem zespołu, pracującego nad powierzonym projektem, wykazuje sie dobrą organizacją pracy swojej jak i zespołu. Dba o prawidłowy przebieg realizacji projektu.

Literatura podstawowa

Węgleński P. (red)., Genetyka Molekularna, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2006, Wydanie VI zmienione
Glick B. R., Pasternak J. J., Molecular biotechnology, ASM, 2003
Phil C. Turner, Alexander G. McLennan, Andy D. Bates, Mike R.H. White, Biologia molekularna. Krótkie wykłady, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2013

Literatura dodatkowa

Krystyna Skwarło-Sońta red. naczelna, KOSMOS - Problemy Nauk Biologiczncych (czasopismo), Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika, Kraków
Allison Lizabeth A., Podstawy biologii molekularnej, Wydawnictwa Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa, 2009

Treści programowe - laboratoria

KOD	Treść programowa	Godziny
T-L-1	Izolacja DNA z komórek bakteryjnych, grzybowych oraz z materiału pochodzenia roślinnego i zwierzęcego	8
T-L-2	Praktyczne wykorzystanie reakcji PCR do wykrywania wybranych patogenów w żywności oraz do identyfikacji składu surowcowego produktów mięsnych	7
		15

Treści programowe - wykłady

KOD	Treść programowa	Godziny
T-W-1	Rozwój metod analizy kwasów nukleinowych	2
T-W-2	Budowa genu eukariotycznego i współczesna definicja genu.	2
T-W-3	Polimorfizm genetyczny i markery molekularne	2
T-W-4	Metody i techniki molekularne wykorzystywane w analizie żywności - Reakcja łańcuchowa polimerazy i jej odmiany - Elektroforeza żelowa - Sekwencjonowanie kwasów nukleinowych - Hybrydyzacja in situ - Mikromacierze DNA	15
T-W-5	Wykorzystanie enzymów restrykcyjnych w analizie żywności	4
T-W-6	Kody kreskowe organizmów żywych (DNA barcoding) i metabarcoding (DNA barcoding z prób środowiskowych).	3
T-W-7	Autentyczność i identyfikowalność żywności	2
		30

Formy aktywności - laboratoria

KOD	Forma aktywności	Godziny
A-L-1	uczestnictwo w zajęciach	15
A-L-2	przygotowanie do pracy w podgrupach	35
A-L-3	przygotowanie się do zaliczenia ćwiczeńlaboratoryjnych	10
		60

(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - wykłady

KOD	Forma aktywności	Godziny
A-W-1	uczestnictwo w zajęciach	30
A-W-2	Studiowanie literatury przedmiotu i przygotowanie się do zaliczenia przedmiotu	30
		60

(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	ZBJZ_1A_PO7-13_W01	Student posiada wiedzę dotyczacą współczesnych metod biologii molekularnej stosowanych w lanalizie żywności
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	ZBJZ_1A_W14	Ma wiedzę na temat podstawowych technik biologii molekularnej i inżynierii genetycznej oraz możliwości wykorzystania organizmów modyfikowanych w przetwórstwie żywności
Cel przedmiotu	C-1	Celem przedmiotu jest przedstawienie i praktyczne zapoznanie się studentów z metodami biologii molekularnej stosowanych w badaniu produktów spożywczych, w szczególności metod opierających się na technice PCR, zasad wykonywania oznaczeń, interpretacji wyników, zalet a także ograniczeń stosowania technik bazujących na amplifikacji DNA
Treści programowe	T-W-1	Rozwój metod analizy kwasów nukleinowych
	T-W-5	Wykorzystanie enzymów restrykcyjnych w analizie żywności
	T-W-3	Polimorfizm genetyczny i markery molekularne
	T-W-4	Metody i techniki molekularne wykorzystywane w analizie żywności - Reakcja łańcuchowa polimerazy i jej odmiany - Elektroforeza żelowa - Sekwencjonowanie kwasów nukleinowych - Hybrydyzacja in situ - Mikromacierze DNA
	T-W-6	Kody kreskowe organizmów żywych (DNA barcoding) i metabarcoding (DNA barcoding z prób środowiskowych).
	T-W-2	Budowa genu eukariotycznego i współczesna definicja genu.
	T-W-7	Autentyczność i identyfikowalność żywności
	T-L-1	Izolacja DNA z komórek bakteryjnych, grzybowych oraz z materiału pochodzenia roślinnego i zwierzęcego
	T-L-2	Praktyczne wykorzystanie reakcji PCR do wykrywania wybranych patogenów w żywności oraz do identyfikacji składu surowcowego produktów mięsnych
Metody nauczania	M-1	Wykład informacyjny prezentujący zagadnienia teoretyczne
Metody nauczania	M-2	Ćwiczenia laboratoryjne
Sposób oceny	S-2	Ocena podsumowująca: Test pisemny, uwzględniający cały zakres materiału omawainy na wykładach i zajęciach laboratoryjnych
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0	Student nie potrafi w najprostszy sposób zaprezentować swojej wiedzy
	3,0	Student prezentuje "suche" wyniki bez umiejętności ich efektywnej analizy.
	3,5	Student prezentuje wyniki z umiejętności ich efektywnej analizy.
	4,0	Student nie tylko efektywnie prezentuje wyniki, ale również dokonuje ich analizy. Potrafi również prowadzić dyskusję o osiągniętych wynikach.
	4,5	Student potrafi efektywnie prezentować, analizować, dyskutować o osiągniętych wynikach oraz oszacować błędy.
	5,0	Student potrafi efektywnie prezentować, analizować, dyskutować o osiągniętych wynikach, a także proponować modyfikacje w układzie pomiarowym.

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	ZBJZ_1A_PO7-13_U01	Student potrafi praktycznie wykorzystać poznane techniki biologii molekularnej w analizie żywności
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	ZBJZ_1A_U02	Potrafi dobrać metody oceny jakości i bezpieczeństwa surowców i produktów żywnościowych
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	ZBJZ_1A_U13	Potrafi ocenić skutki pozytywne i negatywne modyfikacji genetycznych.
Cel przedmiotu	C-1	Celem przedmiotu jest przedstawienie i praktyczne zapoznanie się studentów z metodami biologii molekularnej stosowanych w badaniu produktów spożywczych, w szczególności metod opierających się na technice PCR, zasad wykonywania oznaczeń, interpretacji wyników, zalet a także ograniczeń stosowania technik bazujących na amplifikacji DNA
Treści programowe	T-W-4	Metody i techniki molekularne wykorzystywane w analizie żywności - Reakcja łańcuchowa polimerazy i jej odmiany - Elektroforeza żelowa - Sekwencjonowanie kwasów nukleinowych - Hybrydyzacja in situ - Mikromacierze DNA
	T-L-1	Izolacja DNA z komórek bakteryjnych, grzybowych oraz z materiału pochodzenia roślinnego i zwierzęcego
	T-L-2	Praktyczne wykorzystanie reakcji PCR do wykrywania wybranych patogenów w żywności oraz do identyfikacji składu surowcowego produktów mięsnych
Metody nauczania	M-2	Ćwiczenia laboratoryjne
Sposób oceny	S-1	Ocena formująca: Bieżąca kontrola przygotowania się i poprawności pracy na zajęciach laboratoryjnych
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0	Student nie potrafi zidentyfikować i poradzić sobie samodzielnie z trudnościami mogącymi pojawić się na każdym z etapów pracy, nie operuje wiedzą kontekstową
	3,0	Student potrafi zidentyfikować i poradzić sobie, z nieznaczną pomocą nauczyciela, z wybranymi trudnościami związanymi z procesem przygotowania zleconej pracy
	3,5	Student potrafi zidentyfikować i samodzielnie radzi sobie z podstawowymi trudnościami związanymi z procesem przygotowania zleconej pracy
	4,0	Student potrafi samodzielnie zidentyfikować i radzi sobie z podstawowymi trudnościami związanymi z procesem przygotowania własnego przedsięwzięcia
	4,5	Student samodzielnie identyfikuje i rozwiązuje trudności związane z procesem przygotowania własnego przedsięwzięcia
	5,0	Student samodzielnie identyfikuje i rozwiązuje trudności związane z procesem przygotowania własnego przedsięwzięcia,dzieki posiadanej wiedzy i umiejetnością wykazuje się własną inicjatywą.

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	ZBJZ_1A_PO7-13_K01	Posiada kompetencje oparte na wiedzy i umiejętnościach pozwalające na samodzielne przeprowadzanie analiz żywności technikami biologii molekularnej
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	ZBJZ_1A_K01	Rozumie potrzebę ciągłego dokształcania się i konieczności podnoszenia kompetencji zawodowych. Wyznacza kierunki własnego rozwoju i kształcenia (studia podyplomowe, kursy)
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	ZBJZ_1A_K04	Potrafi myśleć i działać w sposób przedsiębiorczy indywidualnie i w zespole.
Cel przedmiotu	C-1	Celem przedmiotu jest przedstawienie i praktyczne zapoznanie się studentów z metodami biologii molekularnej stosowanych w badaniu produktów spożywczych, w szczególności metod opierających się na technice PCR, zasad wykonywania oznaczeń, interpretacji wyników, zalet a także ograniczeń stosowania technik bazujących na amplifikacji DNA
Treści programowe	T-W-1	Rozwój metod analizy kwasów nukleinowych
	T-W-5	Wykorzystanie enzymów restrykcyjnych w analizie żywności
	T-W-3	Polimorfizm genetyczny i markery molekularne
	T-W-4	Metody i techniki molekularne wykorzystywane w analizie żywności - Reakcja łańcuchowa polimerazy i jej odmiany - Elektroforeza żelowa - Sekwencjonowanie kwasów nukleinowych - Hybrydyzacja in situ - Mikromacierze DNA
	T-W-6	Kody kreskowe organizmów żywych (DNA barcoding) i metabarcoding (DNA barcoding z prób środowiskowych).
	T-W-2	Budowa genu eukariotycznego i współczesna definicja genu.
	T-W-7	Autentyczność i identyfikowalność żywności
	T-L-1	Izolacja DNA z komórek bakteryjnych, grzybowych oraz z materiału pochodzenia roślinnego i zwierzęcego
	T-L-2	Praktyczne wykorzystanie reakcji PCR do wykrywania wybranych patogenów w żywności oraz do identyfikacji składu surowcowego produktów mięsnych
Metody nauczania	M-1	Wykład informacyjny prezentujący zagadnienia teoretyczne
Metody nauczania	M-2	Ćwiczenia laboratoryjne
Sposób oceny	S-1	Ocena formująca: Bieżąca kontrola przygotowania się i poprawności pracy na zajęciach laboratoryjnych
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0	Nie wykazuje potrzeby uzupełniania wiedzy z zakresu biologii molekularnej
	3,0	Ma znikomą świadomość znaczenia ciągłego uzupełniania wiedzy z zakresu biologii molekularnej dla efektywności realizacji powierzonych zadań.
	3,5	Dostrzega w średnim stopniu potrzebę stosowania zdobytej wiedzy w praktyce i poszerzenia zakresu zdobytych informacji
	4,0	Wykazuje w stopniu dobrym dbałość o właściwą realizację powierzonych zadań.
	4,5	Ma dobrą świadomość zagrożenia i posiada dobrą zdolność oceny sytuacji i wykorzystania własnej wiedzy i umiejetności w realizowaniu powierzonych zadań.
	5,0	Może być liderem zespołu, pracującego nad powierzonym projektem, wykazuje sie dobrą organizacją pracy swojej jak i zespołu. Dba o prawidłowy przebieg realizacji projektu.