ZUT - Polska Rama Kwalifikacji / Rok 2022/2023 / Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt / Biotechnologia (S2) / Bioinżynieria / Sylabus przedmiotu

Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Biotechnologia (S2)
specjalność: Bioinżynieria

Sylabus przedmiotu Inżynieria genetyczna:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów	Biotechnologia
Forma studiów	studia stacjonarne	Poziom	drugiego stopnia
Tytuł zawodowy absolwenta	magister inżynier
Obszary studiów	charakterystyki PRK, kompetencje inżynierskie PRK
Profil	ogólnoakademicki
Moduł	—
Przedmiot	Inżynieria genetyczna
Specjalność	przedmiot wspólny
Jednostka prowadząca	Katedra Genetyki
Nauczyciel odpowiedzialny	Andrzej Dybus <Andrzej.Dybus@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele
ECTS (planowane)	5,0	ECTS (formy)	5,0
Forma zaliczenia	egzamin	Język	polski
Blok obieralny	—	Grupa obieralna	—

Formy dydaktyczne

Forma dydaktyczna	KOD	Semestr	Godziny	ECTS	Waga	Zaliczenie
wykłady	W	1	30	2,5	0,59	egzamin
laboratoria	L	1	30	2,5	0,41	zaliczenie

Wymagania wstępne

KOD	Wymaganie wstępne
W-1	Wiedza z zakresu genetyki, biologii molekularnej.

Cele przedmiotu

KOD	Cel modułu/przedmiotu
C-1	Zapoznanie studenta z technikami wykorzystywanymi w tworzeniu organizmów modyfikowanych genetycznie.
C-2	Zapoznanie studenta z metodami analizy DNA.

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KOD	Treść programowa	Godziny
laboratoria
T-L-1	Zasady BHP w laboratorium inżynierii genetycznej. Pozyskiwanie DNA do klonowania.	2
T-L-2	Ocena ilościowa i jakościowa preparatów kwasów nukleinowych.	2
T-L-3	Synteza DNA in vitro. Optymalizacja metody, odmiany.	4
T-L-4	Enzymy restrykcyjne - hydroliza DNA insteru i wektora. Mapy restrykcyjne DNA.	4
T-L-5	Oczyszczanie kwasów nukleinowych po reakcjach enzymatycznych.	2
T-L-6	Ligacja insertu i wektora.	2
T-L-7	Transformacja komórek kompetentnych mieszaniną ligacyjną.	2
T-L-8	Selekcja klonów zrekombinowanych. Przygotowanie hodowli płynnych.	2
T-L-9	Izolacja DNA plazmidowego.	2
T-L-10	Analiza restrykcyjna DNA plazmidów zrekombinowanych. Elektroforeza fragmentów restrykcyjnych.	2
T-L-11	Diagnostyka molekularna chorób genetycznych.	2
T-L-12	Analiza uszkodzeń DNA.	2
T-L-13	Analiza ekspresji transgenów (rt PCR).	2
		30
wykłady
T-W-1	Inżynieria genetyczna – definicja, główne cele modyfikacji genetycznych w ujęciu modelowym i praktycznym, odbiór społeczny.	2
T-W-2	Genom pro- i eukariontów jako podstawowe narzędzie w inżynierii genetycznej - struktura, organizacja, podstawowe funkcje. Nukleosom a nukleoid.	4
T-W-3	Charakterystyka molekularna i biochemiczna enzymów wykorzystywanych w rekombinacji i klonowaniu DNA.	4
T-W-4	Podstawowe techniki wykorzystywane w inżynierii genetycznej.	4
T-W-5	Ogólna charakterystyka wektorów wykorzystywanych w inżynierii genetycznej. Wektory plazmidowe	2
T-W-6	Bakteriofagi jako wektory egzogennego DNA - właściwości, cykl życiowy, modyfikacje genomu dla przyjęcia insertu. Kosmidy.	2
T-W-7	Sztuczne chromosomy jako nośniki egzogennego DNA - BACs, YACs, MACs, SATACs - pojemność, stabilność, zalety i wady.	2
T-W-8	Promotory w konstruktach genowych.	2
T-W-9	Geny reporterowe i markery selekcyjne jako istotny element w wizualizacji i selekcji rekombinowanych komórek.	2
T-W-10	Analiza integracji i ekspresji transgenów.	4
T-W-11	Biblioteki genowe i genomowe - tworzenie, przeszukiwanie.	2
		30

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KOD	Forma aktywności	Godziny
laboratoria
A-L-1	Uczestnictwo w zajęciach laboratoryjnych.	30
A-L-2	Czytanie wskazanej literatury przedmiotu.	15
A-L-3	Przygotowanie do zaliczenia treści ćwiczeń.	17
		62
wykłady
A-W-1	Uczestnictwo w wykładach.	30
A-W-2	Konsultacje	2
A-W-3	Czytanie wskazanej literatury przedmiotu.	10
A-W-4	Przygotowanie do zaliczenia treści wykładów.	21
		63

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KOD	Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1	Wykład informacyjny.
M-2	Opis.
M-3	Ćwiczenia laboratoryjne.
M-4	Metoda projektów.

Sposoby oceny

KOD	Sposób oceny
S-1	Ocena formująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
S-2	Ocena formująca: Pisemne zaliczenie wykładów.
S-3	Ocena formująca: Ocena projektu.

Zamierzone efekty uczenia się - wiedza

Zamierzone efekty uczenia się	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Odniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
BTinz_2A_BT-S1-C09_W01 Definiuje metody wykorzystywane w modyfikacjach genetycznych organizmów.	BTinz_2A_W06	—	—	C-1, C-2	T-L-1, T-L-2, T-L-3, T-L-4, T-L-5, T-L-6, T-L-7, T-L-8, T-L-9, T-L-10, T-L-11, T-L-12, T-L-13, T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4, T-W-5, T-W-9, T-W-10, T-W-11	M-1, M-2, M-3, M-4	S-1, S-2, S-3
BTinz_2A_BT-S1-C09_W02 Charakteryzuje techniki wykorzystywane w analizie kwasów nukleinowych.	BTinz_2A_W05	—	—	C-2	T-L-1, T-L-2, T-L-3, T-L-4, T-L-5, T-L-6, T-L-7, T-L-8, T-L-9, T-L-10, T-L-11, T-L-12, T-L-13, T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4, T-W-5, T-W-9, T-W-10, T-W-11	M-1, M-2, M-3, M-4	S-1, S-2, S-3

Zamierzone efekty uczenia się - umiejętności

Zamierzone efekty uczenia się	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Odniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
BTinz_2A_BT-S1-C09_U01 Potrafi przygotować in silico wektor zrekombinowany do modyfikacji organizmu.	BTinz_2A_U08	—	—	C-1	T-L-1, T-L-2, T-L-3, T-L-4, T-L-5, T-L-6, T-L-7, T-L-8, T-L-9, T-L-10, T-L-11, T-L-12, T-L-13, T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4, T-W-5, T-W-9, T-W-10, T-W-11	M-1, M-2, M-3, M-4	S-1, S-3
BTinz_2A_BT-S1-C09_U02 Potrafi opracować test molekularny w celu diagnostyki zmian w sekwencji kwasów nukleinowych.	BTinz_2A_U02	—	—	C-2	T-L-1, T-L-2, T-L-3, T-L-4, T-L-5, T-L-6, T-L-7, T-L-8, T-L-9, T-L-10, T-L-11, T-L-12, T-L-13, T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4, T-W-5, T-W-9, T-W-10, T-W-11	M-1, M-2, M-3, M-4	S-1, S-2, S-3

Zamierzone efekty uczenia się - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty uczenia się	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Odniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
BTinz_2A_BT-S1-C09_K01 Student jest świadomy możliwości wpływania na cechy fenotypowe organizmów wykorzystywanych w biotechnologii za pośrednictwem różnych metod inżynierii genetycznej	BTinz_2A_K02	—	—	C-1, C-2	T-L-3, T-L-4, T-L-5, T-L-6, T-L-7, T-L-8, T-L-10, T-W-1, T-W-4	M-1, M-3	S-1, S-2

Kryterium oceny - wiedza

Efekt uczenia się	Ocena	Kryterium oceny
BTinz_2A_BT-S1-C09_W01 Definiuje metody wykorzystywane w modyfikacjach genetycznych organizmów.	2,0
	3,0	Student poprawnie wykorzystuje wybrane metody do modyfikacji genetycznych organizmów
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0
BTinz_2A_BT-S1-C09_W02 Charakteryzuje techniki wykorzystywane w analizie kwasów nukleinowych.	2,0
	3,0	Student wykorzystuje niektóre techniki do analizy kwasów nukleinowych
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Kryterium oceny - umiejętności

Efekt uczenia się	Ocena	Kryterium oceny
BTinz_2A_BT-S1-C09_U01 Potrafi przygotować in silico wektor zrekombinowany do modyfikacji organizmu.	2,0
	3,0	Student potrafi zaprezentować zaprojektowany in silico wektor do modyfikacji organizmu, bez jego efektywnej analizy
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0
BTinz_2A_BT-S1-C09_U02 Potrafi opracować test molekularny w celu diagnostyki zmian w sekwencji kwasów nukleinowych.	2,0
	3,0	Student prezentuje opracowanie wybranego testu molekularnego do analizy zmian w sekwencji nukleotydowej bez umiejętności jego efektywnej analizy
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne

Efekt uczenia się	Ocena	Kryterium oceny
BTinz_2A_BT-S1-C09_K01 Student jest świadomy możliwości wpływania na cechy fenotypowe organizmów wykorzystywanych w biotechnologii za pośrednictwem różnych metod inżynierii genetycznej	2,0
	3,0	Student ma niewielką świadomość możliwości wpływania na cechy fenotypowe organizmów wykorzystywanych w biotechnologii za pośrednictwem różnych metod inżynierii genetycznej.
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Literatura podstawowa

Michael R. Green, Joseph Sambrook, Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Fourth Edition), 2012
Terry A. Brown., Genomy, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2012
Jerzy Buchowicz, Biotechnologia molekularna, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2009

Literatura dodatkowa

Colin Ratledge, Bjørn Kristiansen, Podstawy biotechnologii, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2011
Słomski R. (red.), Analiza DNA – teoria i praktyka, Wydawnictwo UP, Poznań, 2008

Treści programowe - laboratoria

KOD	Treść programowa	Godziny
T-L-1	Zasady BHP w laboratorium inżynierii genetycznej. Pozyskiwanie DNA do klonowania.	2
T-L-2	Ocena ilościowa i jakościowa preparatów kwasów nukleinowych.	2
T-L-3	Synteza DNA in vitro. Optymalizacja metody, odmiany.	4
T-L-4	Enzymy restrykcyjne - hydroliza DNA insteru i wektora. Mapy restrykcyjne DNA.	4
T-L-5	Oczyszczanie kwasów nukleinowych po reakcjach enzymatycznych.	2
T-L-6	Ligacja insertu i wektora.	2
T-L-7	Transformacja komórek kompetentnych mieszaniną ligacyjną.	2
T-L-8	Selekcja klonów zrekombinowanych. Przygotowanie hodowli płynnych.	2
T-L-9	Izolacja DNA plazmidowego.	2
T-L-10	Analiza restrykcyjna DNA plazmidów zrekombinowanych. Elektroforeza fragmentów restrykcyjnych.	2
T-L-11	Diagnostyka molekularna chorób genetycznych.	2
T-L-12	Analiza uszkodzeń DNA.	2
T-L-13	Analiza ekspresji transgenów (rt PCR).	2
		30

Treści programowe - wykłady

KOD	Treść programowa	Godziny
T-W-1	Inżynieria genetyczna – definicja, główne cele modyfikacji genetycznych w ujęciu modelowym i praktycznym, odbiór społeczny.	2
T-W-2	Genom pro- i eukariontów jako podstawowe narzędzie w inżynierii genetycznej - struktura, organizacja, podstawowe funkcje. Nukleosom a nukleoid.	4
T-W-3	Charakterystyka molekularna i biochemiczna enzymów wykorzystywanych w rekombinacji i klonowaniu DNA.	4
T-W-4	Podstawowe techniki wykorzystywane w inżynierii genetycznej.	4
T-W-5	Ogólna charakterystyka wektorów wykorzystywanych w inżynierii genetycznej. Wektory plazmidowe	2
T-W-6	Bakteriofagi jako wektory egzogennego DNA - właściwości, cykl życiowy, modyfikacje genomu dla przyjęcia insertu. Kosmidy.	2
T-W-7	Sztuczne chromosomy jako nośniki egzogennego DNA - BACs, YACs, MACs, SATACs - pojemność, stabilność, zalety i wady.	2
T-W-8	Promotory w konstruktach genowych.	2
T-W-9	Geny reporterowe i markery selekcyjne jako istotny element w wizualizacji i selekcji rekombinowanych komórek.	2
T-W-10	Analiza integracji i ekspresji transgenów.	4
T-W-11	Biblioteki genowe i genomowe - tworzenie, przeszukiwanie.	2
		30

Formy aktywności - laboratoria

KOD	Forma aktywności	Godziny
A-L-1	Uczestnictwo w zajęciach laboratoryjnych.	30
A-L-2	Czytanie wskazanej literatury przedmiotu.	15
A-L-3	Przygotowanie do zaliczenia treści ćwiczeń.	17
		62

(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - wykłady

KOD	Forma aktywności	Godziny
A-W-1	Uczestnictwo w wykładach.	30
A-W-2	Konsultacje	2
A-W-3	Czytanie wskazanej literatury przedmiotu.	10
A-W-4	Przygotowanie do zaliczenia treści wykładów.	21
		63

(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia się	BTinz_2A_BT-S1-C09_W01	Definiuje metody wykorzystywane w modyfikacjach genetycznych organizmów.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BTinz_2A_W06	posiada znajomość zaawansowanych metod laboratoryjnych, technik i narzędzi inżynierskich pozwalających na wykonywanie technicznych zadań dostosowanych do kierunku biotechnologia
Cel przedmiotu	C-1	Zapoznanie studenta z technikami wykorzystywanymi w tworzeniu organizmów modyfikowanych genetycznie.
Cel przedmiotu	C-2	Zapoznanie studenta z metodami analizy DNA.
Treści programowe	T-L-1	Zasady BHP w laboratorium inżynierii genetycznej. Pozyskiwanie DNA do klonowania.
	T-L-2	Ocena ilościowa i jakościowa preparatów kwasów nukleinowych.
	T-L-3	Synteza DNA in vitro. Optymalizacja metody, odmiany.
	T-L-4	Enzymy restrykcyjne - hydroliza DNA insteru i wektora. Mapy restrykcyjne DNA.
	T-L-5	Oczyszczanie kwasów nukleinowych po reakcjach enzymatycznych.
	T-L-6	Ligacja insertu i wektora.
	T-L-7	Transformacja komórek kompetentnych mieszaniną ligacyjną.
	T-L-8	Selekcja klonów zrekombinowanych. Przygotowanie hodowli płynnych.
	T-L-9	Izolacja DNA plazmidowego.
	T-L-10	Analiza restrykcyjna DNA plazmidów zrekombinowanych. Elektroforeza fragmentów restrykcyjnych.
	T-L-11	Diagnostyka molekularna chorób genetycznych.
	T-L-12	Analiza uszkodzeń DNA.
	T-L-13	Analiza ekspresji transgenów (rt PCR).
	T-W-1	Inżynieria genetyczna – definicja, główne cele modyfikacji genetycznych w ujęciu modelowym i praktycznym, odbiór społeczny.
	T-W-2	Genom pro- i eukariontów jako podstawowe narzędzie w inżynierii genetycznej - struktura, organizacja, podstawowe funkcje. Nukleosom a nukleoid.
	T-W-3	Charakterystyka molekularna i biochemiczna enzymów wykorzystywanych w rekombinacji i klonowaniu DNA.
	T-W-4	Podstawowe techniki wykorzystywane w inżynierii genetycznej.
	T-W-5	Ogólna charakterystyka wektorów wykorzystywanych w inżynierii genetycznej. Wektory plazmidowe
	T-W-9	Geny reporterowe i markery selekcyjne jako istotny element w wizualizacji i selekcji rekombinowanych komórek.
	T-W-10	Analiza integracji i ekspresji transgenów.
	T-W-11	Biblioteki genowe i genomowe - tworzenie, przeszukiwanie.
Metody nauczania	M-1	Wykład informacyjny.
	M-2	Opis.
	M-3	Ćwiczenia laboratoryjne.
	M-4	Metoda projektów.
Sposób oceny	S-1	Ocena formująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
	S-2	Ocena formująca: Pisemne zaliczenie wykładów.
	S-3	Ocena formująca: Ocena projektu.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Student poprawnie wykorzystuje wybrane metody do modyfikacji genetycznych organizmów
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia się	BTinz_2A_BT-S1-C09_W02	Charakteryzuje techniki wykorzystywane w analizie kwasów nukleinowych.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BTinz_2A_W05	wykazuje pogłębioną wiedzę na temat budowy, funkcji oraz analizy komputerowej genów i genomów, jak również wpływu czynników genetycznych na kształtowanie środowiska
Cel przedmiotu	C-2	Zapoznanie studenta z metodami analizy DNA.
Treści programowe	T-L-1	Zasady BHP w laboratorium inżynierii genetycznej. Pozyskiwanie DNA do klonowania.
	T-L-2	Ocena ilościowa i jakościowa preparatów kwasów nukleinowych.
	T-L-3	Synteza DNA in vitro. Optymalizacja metody, odmiany.
	T-L-4	Enzymy restrykcyjne - hydroliza DNA insteru i wektora. Mapy restrykcyjne DNA.
	T-L-5	Oczyszczanie kwasów nukleinowych po reakcjach enzymatycznych.
	T-L-6	Ligacja insertu i wektora.
	T-L-7	Transformacja komórek kompetentnych mieszaniną ligacyjną.
	T-L-8	Selekcja klonów zrekombinowanych. Przygotowanie hodowli płynnych.
	T-L-9	Izolacja DNA plazmidowego.
	T-L-10	Analiza restrykcyjna DNA plazmidów zrekombinowanych. Elektroforeza fragmentów restrykcyjnych.
	T-L-11	Diagnostyka molekularna chorób genetycznych.
	T-L-12	Analiza uszkodzeń DNA.
	T-L-13	Analiza ekspresji transgenów (rt PCR).
	T-W-1	Inżynieria genetyczna – definicja, główne cele modyfikacji genetycznych w ujęciu modelowym i praktycznym, odbiór społeczny.
	T-W-2	Genom pro- i eukariontów jako podstawowe narzędzie w inżynierii genetycznej - struktura, organizacja, podstawowe funkcje. Nukleosom a nukleoid.
	T-W-3	Charakterystyka molekularna i biochemiczna enzymów wykorzystywanych w rekombinacji i klonowaniu DNA.
	T-W-4	Podstawowe techniki wykorzystywane w inżynierii genetycznej.
	T-W-5	Ogólna charakterystyka wektorów wykorzystywanych w inżynierii genetycznej. Wektory plazmidowe
	T-W-9	Geny reporterowe i markery selekcyjne jako istotny element w wizualizacji i selekcji rekombinowanych komórek.
	T-W-10	Analiza integracji i ekspresji transgenów.
	T-W-11	Biblioteki genowe i genomowe - tworzenie, przeszukiwanie.
Metody nauczania	M-1	Wykład informacyjny.
	M-2	Opis.
	M-3	Ćwiczenia laboratoryjne.
	M-4	Metoda projektów.
Sposób oceny	S-1	Ocena formująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
	S-2	Ocena formująca: Pisemne zaliczenie wykładów.
	S-3	Ocena formująca: Ocena projektu.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Student wykorzystuje niektóre techniki do analizy kwasów nukleinowych
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia się	BTinz_2A_BT-S1-C09_U01	Potrafi przygotować in silico wektor zrekombinowany do modyfikacji organizmu.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BTinz_2A_U08	dobiera i stosuje zaawansowane techniki i narzędzia badawcze wykorzystywane w biotechnologii
Cel przedmiotu	C-1	Zapoznanie studenta z technikami wykorzystywanymi w tworzeniu organizmów modyfikowanych genetycznie.
Treści programowe	T-L-1	Zasady BHP w laboratorium inżynierii genetycznej. Pozyskiwanie DNA do klonowania.
	T-L-2	Ocena ilościowa i jakościowa preparatów kwasów nukleinowych.
	T-L-3	Synteza DNA in vitro. Optymalizacja metody, odmiany.
	T-L-4	Enzymy restrykcyjne - hydroliza DNA insteru i wektora. Mapy restrykcyjne DNA.
	T-L-5	Oczyszczanie kwasów nukleinowych po reakcjach enzymatycznych.
	T-L-6	Ligacja insertu i wektora.
	T-L-7	Transformacja komórek kompetentnych mieszaniną ligacyjną.
	T-L-8	Selekcja klonów zrekombinowanych. Przygotowanie hodowli płynnych.
	T-L-9	Izolacja DNA plazmidowego.
	T-L-10	Analiza restrykcyjna DNA plazmidów zrekombinowanych. Elektroforeza fragmentów restrykcyjnych.
	T-L-11	Diagnostyka molekularna chorób genetycznych.
	T-L-12	Analiza uszkodzeń DNA.
	T-L-13	Analiza ekspresji transgenów (rt PCR).
	T-W-1	Inżynieria genetyczna – definicja, główne cele modyfikacji genetycznych w ujęciu modelowym i praktycznym, odbiór społeczny.
	T-W-2	Genom pro- i eukariontów jako podstawowe narzędzie w inżynierii genetycznej - struktura, organizacja, podstawowe funkcje. Nukleosom a nukleoid.
	T-W-3	Charakterystyka molekularna i biochemiczna enzymów wykorzystywanych w rekombinacji i klonowaniu DNA.
	T-W-4	Podstawowe techniki wykorzystywane w inżynierii genetycznej.
	T-W-5	Ogólna charakterystyka wektorów wykorzystywanych w inżynierii genetycznej. Wektory plazmidowe
	T-W-9	Geny reporterowe i markery selekcyjne jako istotny element w wizualizacji i selekcji rekombinowanych komórek.
	T-W-10	Analiza integracji i ekspresji transgenów.
	T-W-11	Biblioteki genowe i genomowe - tworzenie, przeszukiwanie.
Metody nauczania	M-1	Wykład informacyjny.
	M-2	Opis.
	M-3	Ćwiczenia laboratoryjne.
	M-4	Metoda projektów.
Sposób oceny	S-1	Ocena formująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
Sposób oceny	S-3	Ocena formująca: Ocena projektu.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Student potrafi zaprezentować zaprojektowany in silico wektor do modyfikacji organizmu, bez jego efektywnej analizy
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia się	BTinz_2A_BT-S1-C09_U02	Potrafi opracować test molekularny w celu diagnostyki zmian w sekwencji kwasów nukleinowych.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BTinz_2A_U02	umie zaplanować i analizować badania biotechnologiczne z wykorzystaniem narzędzi bioinformatycznych
Cel przedmiotu	C-2	Zapoznanie studenta z metodami analizy DNA.
Treści programowe	T-L-1	Zasady BHP w laboratorium inżynierii genetycznej. Pozyskiwanie DNA do klonowania.
	T-L-2	Ocena ilościowa i jakościowa preparatów kwasów nukleinowych.
	T-L-3	Synteza DNA in vitro. Optymalizacja metody, odmiany.
	T-L-4	Enzymy restrykcyjne - hydroliza DNA insteru i wektora. Mapy restrykcyjne DNA.
	T-L-5	Oczyszczanie kwasów nukleinowych po reakcjach enzymatycznych.
	T-L-6	Ligacja insertu i wektora.
	T-L-7	Transformacja komórek kompetentnych mieszaniną ligacyjną.
	T-L-8	Selekcja klonów zrekombinowanych. Przygotowanie hodowli płynnych.
	T-L-9	Izolacja DNA plazmidowego.
	T-L-10	Analiza restrykcyjna DNA plazmidów zrekombinowanych. Elektroforeza fragmentów restrykcyjnych.
	T-L-11	Diagnostyka molekularna chorób genetycznych.
	T-L-12	Analiza uszkodzeń DNA.
	T-L-13	Analiza ekspresji transgenów (rt PCR).
	T-W-1	Inżynieria genetyczna – definicja, główne cele modyfikacji genetycznych w ujęciu modelowym i praktycznym, odbiór społeczny.
	T-W-2	Genom pro- i eukariontów jako podstawowe narzędzie w inżynierii genetycznej - struktura, organizacja, podstawowe funkcje. Nukleosom a nukleoid.
	T-W-3	Charakterystyka molekularna i biochemiczna enzymów wykorzystywanych w rekombinacji i klonowaniu DNA.
	T-W-4	Podstawowe techniki wykorzystywane w inżynierii genetycznej.
	T-W-5	Ogólna charakterystyka wektorów wykorzystywanych w inżynierii genetycznej. Wektory plazmidowe
	T-W-9	Geny reporterowe i markery selekcyjne jako istotny element w wizualizacji i selekcji rekombinowanych komórek.
	T-W-10	Analiza integracji i ekspresji transgenów.
	T-W-11	Biblioteki genowe i genomowe - tworzenie, przeszukiwanie.
Metody nauczania	M-1	Wykład informacyjny.
	M-2	Opis.
	M-3	Ćwiczenia laboratoryjne.
	M-4	Metoda projektów.
Sposób oceny	S-1	Ocena formująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
	S-2	Ocena formująca: Pisemne zaliczenie wykładów.
	S-3	Ocena formująca: Ocena projektu.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Student prezentuje opracowanie wybranego testu molekularnego do analizy zmian w sekwencji nukleotydowej bez umiejętności jego efektywnej analizy
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia się	BTinz_2A_BT-S1-C09_K01	Student jest świadomy możliwości wpływania na cechy fenotypowe organizmów wykorzystywanych w biotechnologii za pośrednictwem różnych metod inżynierii genetycznej
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BTinz_2A_K02	wykazuje zrozumienie procesów biotechnologicznych wykorzystywanych w różnych obszarach działalności człowieka; interpretuje i opisuje te procesy wykorzystując podejście naukowe
Cel przedmiotu	C-1	Zapoznanie studenta z technikami wykorzystywanymi w tworzeniu organizmów modyfikowanych genetycznie.
Cel przedmiotu	C-2	Zapoznanie studenta z metodami analizy DNA.
Treści programowe	T-L-3	Synteza DNA in vitro. Optymalizacja metody, odmiany.
	T-L-4	Enzymy restrykcyjne - hydroliza DNA insteru i wektora. Mapy restrykcyjne DNA.
	T-L-5	Oczyszczanie kwasów nukleinowych po reakcjach enzymatycznych.
	T-L-6	Ligacja insertu i wektora.
	T-L-7	Transformacja komórek kompetentnych mieszaniną ligacyjną.
	T-L-8	Selekcja klonów zrekombinowanych. Przygotowanie hodowli płynnych.
	T-L-10	Analiza restrykcyjna DNA plazmidów zrekombinowanych. Elektroforeza fragmentów restrykcyjnych.
	T-W-1	Inżynieria genetyczna – definicja, główne cele modyfikacji genetycznych w ujęciu modelowym i praktycznym, odbiór społeczny.
	T-W-4	Podstawowe techniki wykorzystywane w inżynierii genetycznej.
Metody nauczania	M-1	Wykład informacyjny.
Metody nauczania	M-3	Ćwiczenia laboratoryjne.
Sposób oceny	S-1	Ocena formująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
Sposób oceny	S-2	Ocena formująca: Pisemne zaliczenie wykładów.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Student ma niewielką świadomość możliwości wpływania na cechy fenotypowe organizmów wykorzystywanych w biotechnologii za pośrednictwem różnych metod inżynierii genetycznej.
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0