Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Biotechnology (S2)
Sylabus przedmiotu Basics of contemporary microscopy:
Informacje podstawowe
| Kierunek studiów | Biotechnology | ||
|---|---|---|---|
| Forma studiów | studia stacjonarne | Poziom | drugiego stopnia |
| Tytuł zawodowy absolwenta | magister inżynier | ||
| Obszary studiów | charakterystyki PRK, kompetencje inżynierskie PRK | ||
| Profil | ogólnoakademicki | ||
| Moduł | — | ||
| Przedmiot | Basics of contemporary microscopy | ||
| Specjalność | przedmiot wspólny | ||
| Jednostka prowadząca | Katedra Fizjologii, Cytobiologii i Proteomiki | ||
| Nauczyciel odpowiedzialny | Katarzyna Michałek <Katarzyna.Michalek@zut.edu.pl> | ||
| Inni nauczyciele | Agnieszka Kochmańska <Agnieszka.Kochmanska@zut.edu.pl> | ||
| ECTS (planowane) | 4,0 | ECTS (formy) | 4,0 |
| Forma zaliczenia | egzamin | Język | angielski |
| Blok obieralny | — | Grupa obieralna | — |
Formy dydaktyczne
Wymagania wstępne
| KOD | Wymaganie wstępne |
|---|---|
| W-1 | Basics of the physics and structure, morphology of living organisms |
Cele przedmiotu
| KOD | Cel modułu/przedmiotu |
|---|---|
| C-1 | Get knowledge about modern microscopy |
| C-2 | To familiarise students with the microscopy techniques and equipment used in the study of living organisms structure |
Treści programowe z podziałem na formy zajęć
| KOD | Treść programowa | Godziny |
|---|---|---|
| laboratoria | ||
| T-L-1 | Drying at a critical point of CO2, vacuum spraying of samples using in SEM, observations in SEM, interpretation of SE and BSE images. | 3 |
| T-L-2 | Optical microscopy. Metallographic and biologic microscope. Observations in the light and dark field; in polarized light and using interference contrast. | 3 |
| T-L-3 | X-ray EDS microanalysis. | 2 |
| T-L-4 | Atomic force microscope AFM | 2 |
| T-L-5 | The hematoxylin and eosine procedures (H&E). Application of H&E stain. Staining of tissue section with the use of H&E technique. | 3 |
| T-L-6 | Histochemical techniques of tissue staining. Application of periodic acid Schiff (PAS) stain. Staining of renal tissue wit the use of PAS technique. | 3 |
| T-L-7 | Immunohistechemistry (IHC). Application of IHC. Antigen retrieval. Permabilization. Blocking. Primary antibody selection and optimization. Antibody specifity. Chromogenic detection. IHC controls. Immunolocalization of aquaporin 1 (AQP1) in the renal cortex and medulla | 4 |
| 20 | ||
| wykłady | ||
| T-W-1 | Basics of light optics. Construction of an optical microscope. Types of microscopic techniques in modern biology. | 3 |
| T-W-2 | Basics of electron optics. | 1 |
| T-W-3 | Scanning electron microscope SEM. Principle of working, construction of the microscope. Types of images. Preparation. | 3 |
| T-W-4 | Transmission electron microscope TEM. Principle of working, construction of the microscope. Preparation. | 3 |
| T-W-5 | X-ray microanalysis EDS and WDS. | 2 |
| T-W-6 | Scanning Probe Microscope SPM: Scanning Tunelling Microscope STM; Atomic Force Microscope AFM. | 2 |
| T-W-7 | Collection and preparation of biological samples for microscopic examination. Fixation, dehydratation, embedding and sectioning. Tissue preservation. Parraffin-embedded tissue. Frozen tissue. Microtome. Crystostat. | 2 |
| T-W-8 | Tissue staining. Histological techniques (hematoxylin and eosin (H&E), periodic acid Schiff (PAS), Masson’s trichome stain, van Gison’s stain. Immunohistochemistry application. Analysis and interpretation of microscopic images | 4 |
| 20 | ||
Obciążenie pracą studenta - formy aktywności
| KOD | Forma aktywności | Godziny |
|---|---|---|
| laboratoria | ||
| A-L-1 | Mandatory participation in laboratories | 20 |
| A-L-2 | Study of recommended literature | 10 |
| A-L-3 | Preparing for the laboratory analysis | 20 |
| A-L-4 | Consultation with the teacher | 10 |
| 60 | ||
| wykłady | ||
| A-W-1 | Participation in lectures | 20 |
| A-W-2 | Learning for the colloquium | 10 |
| A-W-3 | Consultation with the teacher | 10 |
| A-W-4 | Self study content of the lectures | 10 |
| A-W-5 | Study of recommended literature | 10 |
| 60 | ||
Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne
| KOD | Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne |
|---|---|
| M-1 | Informative lectures with the use of multimedia presentation |
| M-2 | Laboratory works |
Sposoby oceny
| KOD | Sposób oceny |
|---|---|
| S-1 | Ocena formująca: written test |
| S-2 | Ocena formująca: Assesment of student activity and preparing for classes |
Zamierzone efekty uczenia się - wiedza
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BTap_2A_BTA-A-D1_W01 Student has a basic knowledge in the frame of material program. Student can enurate and describe commonly used microscopic techniques. | BTap_2A_W01 | — | — | C-1, C-2 | T-W-1, T-W-2, T-W-8, T-W-3, T-W-7, T-W-5, T-W-6, T-W-4 | M-1 | S-1 |
Zamierzone efekty uczenia się - umiejętności
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BTap_2A_BTA-A-D1_U01 Student is able to use commonly know microscopic techniques | BTap_2A_U08 | — | — | C-1, C-2 | T-L-5, T-L-6, T-L-1, T-L-2, T-L-7, T-L-3, T-L-4 | M-2 | S-2 |
Zamierzone efekty uczenia się - inne kompetencje społeczne i personalne
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BTap_2A_BTA-A-D1_K01 Student ia aware that there is a number microscopic methods to analyse structure of living organism. | BTap_2A_K05 | — | — | C-1 | T-L-5, T-L-6, T-L-1, T-L-2, T-L-7, T-L-3, T-L-4, T-W-1, T-W-2, T-W-8, T-W-3, T-W-7, T-W-5, T-W-6, T-W-4 | M-1, M-2 | S-2 |
Kryterium oceny - wiedza
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| BTap_2A_BTA-A-D1_W01 Student has a basic knowledge in the frame of material program. Student can enurate and describe commonly used microscopic techniques. | 2,0 | |
| 3,0 | Student has a basic knowledge in the frame of material program | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Kryterium oceny - umiejętności
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| BTap_2A_BTA-A-D1_U01 Student is able to use commonly know microscopic techniques | 2,0 | |
| 3,0 | Student with the help of teacher is able to use commonlly know microscopic techniques | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| BTap_2A_BTA-A-D1_K01 Student ia aware that there is a number microscopic methods to analyse structure of living organism. | 2,0 | |
| 3,0 | Student express moderate interest in participating in verbal disccusion with the teacher and classmates during classes | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Literatura podstawowa
- BRUCKER, MICROX-RAY FLUORESCENCE SPECTROSCOPY, John Wiley & Sons Ltd, 2015
- M. A. Nasser Hajibagheri, Electron Microscopy Methods and Protocols; Methods in Molecular Biology,VOLUME 117, HUMANA PRESS, 2011
- William Croft, Under the microscope A brief history of microscopy, World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd., 2006