Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie

Wydział Nauk o Żywności i Rybactwa - Ichtiologia i akwakultura (S1)

Sylabus przedmiotu Choroby wirusowe organizmów wodnych:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów Ichtiologia i akwakultura
Forma studiów studia stacjonarne Poziom pierwszego stopnia
Tytuł zawodowy absolwenta inżynier
Obszary studiów charakterystyki PRK, kompetencje inżynierskie PRK
Profil ogólnoakademicki
Moduł
Przedmiot Choroby wirusowe organizmów wodnych
Specjalność Biotechnologia rybacka i akwakultura
Jednostka prowadząca Katedra Bioinżynierii Środowiska Wodnego i Akwakultury
Nauczyciel odpowiedzialny Jolanta Kiełpińska <Jolanta.Kielpinska@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele
ECTS (planowane) 5,0 ECTS (formy) 5,0
Forma zaliczenia zaliczenie Język polski
Blok obieralny Grupa obieralna

Formy dydaktyczne

Forma dydaktycznaKODSemestrGodzinyECTSWagaZaliczenie
laboratoriaL7 30 3,00,50zaliczenie
wykładyW7 30 2,00,50zaliczenie

Wymagania wstępne

KODWymaganie wstępne
W-1Podstawowa wiedza z zakresu biologii, chorób ryb, anatomii i genetyki.

Cele przedmiotu

KODCel modułu/przedmiotu
C-1Zapoznanie studentów ze specyfiką infekcji wirusowych, ich przebiegiem, diagnostyką oraz metodami profilaktyki i higieny.

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KODTreść programowaGodziny
laboratoria
T-L-1Pobieranie i zabezpieczanie materiału biologicznego do diagnostyki wirusologicznej.4
T-L-2Sekcja ryb - poobór materiału do diagnostyki wirusologicznej i jego konserwacja4
T-L-3Sekcja małży - pobór materiału do diagnostyki wirusologicznej i jego konserwacja.4
T-L-4Homogenizacja prób i przygotowanie do analizy molekularnej.2
T-L-5Optymalizacja reakcji PCR w aspekcie podwyższenia jej czułości. Real-time PCR2
T-L-6Interpretacja wyników. Wyniki fałszywie negatywne i pozytywne.2
T-L-7Wyposażenie laboratorium do badań wirusologicznych. Zasady pracy i bezpieczeństwa.4
T-L-8Analiza przykładowych sekwencji. Charakterystyka molekularna wirusów.4
T-L-9Metody zabezpieczania hodowli przed infekcją wirusową. Profilaktyka i higiena.3
T-L-10Zaliczenie1
30
wykłady
T-W-1Właściwości wirusów i ich klasyfikacja. Genomy wirusów DNA i RNA. Replikacja genomów wirusowych4
T-W-2Namnażanie wirusów w laboratoriach. Hodowle komórkowe i tkankowe.2
T-W-3Infekcje wirusowe. Zapobieganie i zwalczanie. Interferony. Szczepionki. Patogenność i wirulencja.4
T-W-4Odporność na zakażenie. Mechanizmy odporności. Odporność immunologiczna.2
T-W-5Wirusy a populacja. Podstawy epidemiologii.2
T-W-6Wybrane choroby wirusowe ryb.4
T-W-7Wybrane choroby wirusowe bezkręgowców wodnych.4
T-W-8Wybrane zagadnienia z diagnostyki wirusologicznej. Metody bezposredniego i posredniego wykrywania wirusów.4
T-W-9Zarys wisrusologii molekularnej.3
T-W-10Zaliczenie1
30

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KODForma aktywnościGodziny
laboratoria
A-L-1uczestnictwo w zajęciach30
A-L-2Przygotowanie do ćwiczeń, studiowanie literatury przedmiotu43
A-L-3Konsultacje z prowadzącym2
75
wykłady
A-W-1uczestnictwo w zajęciach30
A-W-2Konsultacje z prowadzącym1
A-W-3Przygotowanie do zaliczenia przedmiotu19
50

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KODMetoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1Wykład informacyjny
M-2Seminarium
M-3Metoda programowa z użyciem komputera
M-4Pokaz, symulacja

Sposoby oceny

KODSposób oceny
S-1Ocena formująca: Ocena formująca
S-2Ocena formująca: Ocena podsumowująca

Zamierzone efekty uczenia się - wiedza

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
IA_1A_D2-10_W01
Student rozumie pojęcia i terminologię wirusologiczną oraz potrafi scharakteryzować wybrane choroby wirusowe organizmów wodnych z ogólnym wskazaniem na profilaktyke i możliwości diagnostyczne.
IA_1A_W04, IA_1A_W05, IA_1A_W10C-1T-L-8, T-L-1, T-L-2, T-L-3, T-L-4, T-L-5, T-L-6, T-L-7, T-L-9, T-W-9, T-W-7, T-W-8, T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4, T-W-5, T-W-6M-1, M-2, M-3, M-4S-1, S-2

Zamierzone efekty uczenia się - umiejętności

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
IA_1A_D2-10_U01
Student potrafi wykonać sekcję ryby i małży oraz pobrać i zabezpieczyć fragmenty tkanek do badań wirusologicznych. Potrafi w ogólnym zarysie przedstawić metodykę analizy molekularnej fragmentu genomu wurusowego ze wstępną oceną jego patogenności.
IA_1A_U07, IA_1A_U08, IA_1A_U06C-1T-L-8, T-L-1, T-L-2, T-L-3, T-L-4, T-L-5, T-L-6, T-L-7, T-L-9, T-W-9, T-W-7, T-W-8, T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4, T-W-5, T-W-6M-1, M-2, M-3, M-4S-1

Zamierzone efekty uczenia się - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
IA_1A_D2-10_K01
Student ma świadomość swojej wiedzy i umiejętności oraz możliwości profilaktyki i diagnostyki przy infekcjach wirusowych organizmów wodnych.
IA_1A_K03C-1T-L-8, T-L-1, T-L-2, T-L-3, T-L-4, T-L-5, T-L-6, T-L-7, T-L-9, T-W-9, T-W-7, T-W-8, T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4, T-W-5, T-W-6M-2, M-4S-1

Kryterium oceny - wiedza

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
IA_1A_D2-10_W01
Student rozumie pojęcia i terminologię wirusologiczną oraz potrafi scharakteryzować wybrane choroby wirusowe organizmów wodnych z ogólnym wskazaniem na profilaktyke i możliwości diagnostyczne.
2,0
3,0Student posiada podstawowy zasób wiedzy z zakresu przebiegu infekcji wirusowych o organizmów wodnych. Orientuje się w specyfice środowiska wodnego jako medium dla wektorów chorób wirusowych. Zna w zakresie ogólnym terminologie wirusologiczną.
3,5
4,0
4,5
5,0

Kryterium oceny - umiejętności

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
IA_1A_D2-10_U01
Student potrafi wykonać sekcję ryby i małży oraz pobrać i zabezpieczyć fragmenty tkanek do badań wirusologicznych. Potrafi w ogólnym zarysie przedstawić metodykę analizy molekularnej fragmentu genomu wurusowego ze wstępną oceną jego patogenności.
2,0
3,0Student potrafi ocenić postać kliniczną infekcji wirusowej, potrafi dokonać poboru materiału biologicznego do badań diagnostycznych oraz zna metody profilaktyki i higieny.
3,5
4,0
4,5
5,0

Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
IA_1A_D2-10_K01
Student ma świadomość swojej wiedzy i umiejętności oraz możliwości profilaktyki i diagnostyki przy infekcjach wirusowych organizmów wodnych.
2,0
3,0Student ma świadomość swojej wiedzy i niebezpieczeństwa wynikającego z szybkości roozprzestrzeniania się chorób wirusowych w środowisku wodnym.
3,5
4,0
4,5
5,0

Literatura podstawowa

  1. Collier L., Oxford J., Wirusologia, PZWL, Warszawa, 1993, Drugie
  2. Lewbart G.A., Invertebrate medicine, Blackwell, Australia, 2006, Pierwsze
  3. Piekarowicz A., Podstawy wirusologii molekularnej, PWN, Warszawa, 2004

Literatura dodatkowa

  1. Goździcka-Józefiak A., Wirusologia molekularna, UAM, Poznań, 2004
  2. Żelazny J., Środowisko a stan zdrowotny karpia., Państwowy Instytut Weterynaryjny, Puławy, 2002

Treści programowe - laboratoria

KODTreść programowaGodziny
T-L-1Pobieranie i zabezpieczanie materiału biologicznego do diagnostyki wirusologicznej.4
T-L-2Sekcja ryb - poobór materiału do diagnostyki wirusologicznej i jego konserwacja4
T-L-3Sekcja małży - pobór materiału do diagnostyki wirusologicznej i jego konserwacja.4
T-L-4Homogenizacja prób i przygotowanie do analizy molekularnej.2
T-L-5Optymalizacja reakcji PCR w aspekcie podwyższenia jej czułości. Real-time PCR2
T-L-6Interpretacja wyników. Wyniki fałszywie negatywne i pozytywne.2
T-L-7Wyposażenie laboratorium do badań wirusologicznych. Zasady pracy i bezpieczeństwa.4
T-L-8Analiza przykładowych sekwencji. Charakterystyka molekularna wirusów.4
T-L-9Metody zabezpieczania hodowli przed infekcją wirusową. Profilaktyka i higiena.3
T-L-10Zaliczenie1
30

Treści programowe - wykłady

KODTreść programowaGodziny
T-W-1Właściwości wirusów i ich klasyfikacja. Genomy wirusów DNA i RNA. Replikacja genomów wirusowych4
T-W-2Namnażanie wirusów w laboratoriach. Hodowle komórkowe i tkankowe.2
T-W-3Infekcje wirusowe. Zapobieganie i zwalczanie. Interferony. Szczepionki. Patogenność i wirulencja.4
T-W-4Odporność na zakażenie. Mechanizmy odporności. Odporność immunologiczna.2
T-W-5Wirusy a populacja. Podstawy epidemiologii.2
T-W-6Wybrane choroby wirusowe ryb.4
T-W-7Wybrane choroby wirusowe bezkręgowców wodnych.4
T-W-8Wybrane zagadnienia z diagnostyki wirusologicznej. Metody bezposredniego i posredniego wykrywania wirusów.4
T-W-9Zarys wisrusologii molekularnej.3
T-W-10Zaliczenie1
30

Formy aktywności - laboratoria

KODForma aktywnościGodziny
A-L-1uczestnictwo w zajęciach30
A-L-2Przygotowanie do ćwiczeń, studiowanie literatury przedmiotu43
A-L-3Konsultacje z prowadzącym2
75
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - wykłady

KODForma aktywnościGodziny
A-W-1uczestnictwo w zajęciach30
A-W-2Konsultacje z prowadzącym1
A-W-3Przygotowanie do zaliczenia przedmiotu19
50
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięIA_1A_D2-10_W01Student rozumie pojęcia i terminologię wirusologiczną oraz potrafi scharakteryzować wybrane choroby wirusowe organizmów wodnych z ogólnym wskazaniem na profilaktyke i możliwości diagnostyczne.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówIA_1A_W04Zna i rozumie w zaawansowanym stopniu zagadnienia z zakresu drobnoustrojów i ich roli w środowisku wodnym z uwzględnieniem metod ich wykrywania i oznaczania.
IA_1A_W05Zna i rozumie w zaawansowanym stopniu zagadnienia z zakresu biologii i taksonomii organizmów wodnych ze szczególnym uwzględnieniem ryb i bezkręgowców mających znaczenie gospodarcze w rybactwie.
IA_1A_W10Zna i rozumie w zaawansowanym stopniu zagadnienia z zakresu terminologii stosowanej w genetyce oraz sposobów wykorzystania zasad inżynierii genetycznej w hodowli organizmów wodnych.
Cel przedmiotuC-1Zapoznanie studentów ze specyfiką infekcji wirusowych, ich przebiegiem, diagnostyką oraz metodami profilaktyki i higieny.
Treści programoweT-L-8Analiza przykładowych sekwencji. Charakterystyka molekularna wirusów.
T-L-1Pobieranie i zabezpieczanie materiału biologicznego do diagnostyki wirusologicznej.
T-L-2Sekcja ryb - poobór materiału do diagnostyki wirusologicznej i jego konserwacja
T-L-3Sekcja małży - pobór materiału do diagnostyki wirusologicznej i jego konserwacja.
T-L-4Homogenizacja prób i przygotowanie do analizy molekularnej.
T-L-5Optymalizacja reakcji PCR w aspekcie podwyższenia jej czułości. Real-time PCR
T-L-6Interpretacja wyników. Wyniki fałszywie negatywne i pozytywne.
T-L-7Wyposażenie laboratorium do badań wirusologicznych. Zasady pracy i bezpieczeństwa.
T-L-9Metody zabezpieczania hodowli przed infekcją wirusową. Profilaktyka i higiena.
T-W-9Zarys wisrusologii molekularnej.
T-W-7Wybrane choroby wirusowe bezkręgowców wodnych.
T-W-8Wybrane zagadnienia z diagnostyki wirusologicznej. Metody bezposredniego i posredniego wykrywania wirusów.
T-W-1Właściwości wirusów i ich klasyfikacja. Genomy wirusów DNA i RNA. Replikacja genomów wirusowych
T-W-2Namnażanie wirusów w laboratoriach. Hodowle komórkowe i tkankowe.
T-W-3Infekcje wirusowe. Zapobieganie i zwalczanie. Interferony. Szczepionki. Patogenność i wirulencja.
T-W-4Odporność na zakażenie. Mechanizmy odporności. Odporność immunologiczna.
T-W-5Wirusy a populacja. Podstawy epidemiologii.
T-W-6Wybrane choroby wirusowe ryb.
Metody nauczaniaM-1Wykład informacyjny
M-2Seminarium
M-3Metoda programowa z użyciem komputera
M-4Pokaz, symulacja
Sposób ocenyS-1Ocena formująca: Ocena formująca
S-2Ocena formująca: Ocena podsumowująca
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Student posiada podstawowy zasób wiedzy z zakresu przebiegu infekcji wirusowych o organizmów wodnych. Orientuje się w specyfice środowiska wodnego jako medium dla wektorów chorób wirusowych. Zna w zakresie ogólnym terminologie wirusologiczną.
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięIA_1A_D2-10_U01Student potrafi wykonać sekcję ryby i małży oraz pobrać i zabezpieczyć fragmenty tkanek do badań wirusologicznych. Potrafi w ogólnym zarysie przedstawić metodykę analizy molekularnej fragmentu genomu wurusowego ze wstępną oceną jego patogenności.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówIA_1A_U07Potrafi posługiwać się poprawną nomenklaturą, podejmować standardowe działania z wykorzystaniem odpowiednich metod w zakresie higieny, profilaktyki i toksykologii w celu zapewnienia zdrowia i prawidłowego dobrostanu zwierząt wodnych.
IA_1A_U08Potrafi posługiwać się poprawną nomenklaturą w zakresie mikrobiologii. Potrafi dokonać wyboru właściwych technik diagnostycznych przy ukierunkowanej analizie mikrobiologicznej.
IA_1A_U06Potrafi zidentyfikować i scharakteryzować wybrane fito i zoobionty środowiska wodnego, określić ich znaczenie dla rybactwa oraz potrafi wskazać możliwośći przktycznego wykorzysania hydrobionów w samooczyszczaniu środwiska wodnego.
Cel przedmiotuC-1Zapoznanie studentów ze specyfiką infekcji wirusowych, ich przebiegiem, diagnostyką oraz metodami profilaktyki i higieny.
Treści programoweT-L-8Analiza przykładowych sekwencji. Charakterystyka molekularna wirusów.
T-L-1Pobieranie i zabezpieczanie materiału biologicznego do diagnostyki wirusologicznej.
T-L-2Sekcja ryb - poobór materiału do diagnostyki wirusologicznej i jego konserwacja
T-L-3Sekcja małży - pobór materiału do diagnostyki wirusologicznej i jego konserwacja.
T-L-4Homogenizacja prób i przygotowanie do analizy molekularnej.
T-L-5Optymalizacja reakcji PCR w aspekcie podwyższenia jej czułości. Real-time PCR
T-L-6Interpretacja wyników. Wyniki fałszywie negatywne i pozytywne.
T-L-7Wyposażenie laboratorium do badań wirusologicznych. Zasady pracy i bezpieczeństwa.
T-L-9Metody zabezpieczania hodowli przed infekcją wirusową. Profilaktyka i higiena.
T-W-9Zarys wisrusologii molekularnej.
T-W-7Wybrane choroby wirusowe bezkręgowców wodnych.
T-W-8Wybrane zagadnienia z diagnostyki wirusologicznej. Metody bezposredniego i posredniego wykrywania wirusów.
T-W-1Właściwości wirusów i ich klasyfikacja. Genomy wirusów DNA i RNA. Replikacja genomów wirusowych
T-W-2Namnażanie wirusów w laboratoriach. Hodowle komórkowe i tkankowe.
T-W-3Infekcje wirusowe. Zapobieganie i zwalczanie. Interferony. Szczepionki. Patogenność i wirulencja.
T-W-4Odporność na zakażenie. Mechanizmy odporności. Odporność immunologiczna.
T-W-5Wirusy a populacja. Podstawy epidemiologii.
T-W-6Wybrane choroby wirusowe ryb.
Metody nauczaniaM-1Wykład informacyjny
M-2Seminarium
M-3Metoda programowa z użyciem komputera
M-4Pokaz, symulacja
Sposób ocenyS-1Ocena formująca: Ocena formująca
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Student potrafi ocenić postać kliniczną infekcji wirusowej, potrafi dokonać poboru materiału biologicznego do badań diagnostycznych oraz zna metody profilaktyki i higieny.
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięIA_1A_D2-10_K01Student ma świadomość swojej wiedzy i umiejętności oraz możliwości profilaktyki i diagnostyki przy infekcjach wirusowych organizmów wodnych.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówIA_1A_K03Jest gotów do podporządkowania się zasadom pracy w zespole i ponoszenia odpowiedzialności za wspólnie realizowane zadanie.
Cel przedmiotuC-1Zapoznanie studentów ze specyfiką infekcji wirusowych, ich przebiegiem, diagnostyką oraz metodami profilaktyki i higieny.
Treści programoweT-L-8Analiza przykładowych sekwencji. Charakterystyka molekularna wirusów.
T-L-1Pobieranie i zabezpieczanie materiału biologicznego do diagnostyki wirusologicznej.
T-L-2Sekcja ryb - poobór materiału do diagnostyki wirusologicznej i jego konserwacja
T-L-3Sekcja małży - pobór materiału do diagnostyki wirusologicznej i jego konserwacja.
T-L-4Homogenizacja prób i przygotowanie do analizy molekularnej.
T-L-5Optymalizacja reakcji PCR w aspekcie podwyższenia jej czułości. Real-time PCR
T-L-6Interpretacja wyników. Wyniki fałszywie negatywne i pozytywne.
T-L-7Wyposażenie laboratorium do badań wirusologicznych. Zasady pracy i bezpieczeństwa.
T-L-9Metody zabezpieczania hodowli przed infekcją wirusową. Profilaktyka i higiena.
T-W-9Zarys wisrusologii molekularnej.
T-W-7Wybrane choroby wirusowe bezkręgowców wodnych.
T-W-8Wybrane zagadnienia z diagnostyki wirusologicznej. Metody bezposredniego i posredniego wykrywania wirusów.
T-W-1Właściwości wirusów i ich klasyfikacja. Genomy wirusów DNA i RNA. Replikacja genomów wirusowych
T-W-2Namnażanie wirusów w laboratoriach. Hodowle komórkowe i tkankowe.
T-W-3Infekcje wirusowe. Zapobieganie i zwalczanie. Interferony. Szczepionki. Patogenność i wirulencja.
T-W-4Odporność na zakażenie. Mechanizmy odporności. Odporność immunologiczna.
T-W-5Wirusy a populacja. Podstawy epidemiologii.
T-W-6Wybrane choroby wirusowe ryb.
Metody nauczaniaM-2Seminarium
M-4Pokaz, symulacja
Sposób ocenyS-1Ocena formująca: Ocena formująca
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Student ma świadomość swojej wiedzy i niebezpieczeństwa wynikającego z szybkości roozprzestrzeniania się chorób wirusowych w środowisku wodnym.
3,5
4,0
4,5
5,0