Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie

Administracja Centralna Uczelni - Wymiana międzynarodowa (S1)

Sylabus przedmiotu Genetic engineering:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów Wymiana międzynarodowa
Forma studiów studia stacjonarne Poziom pierwszego stopnia
Tytuł zawodowy absolwenta
Obszary studiów
Profil
Moduł
Przedmiot Genetic engineering
Specjalność przedmiot wspólny
Jednostka prowadząca Katedra Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin
Nauczyciel odpowiedzialny Miłosz Smolik <Milosz.Smolik@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele Paweł Milczarski <Pawel.Milczarski@zut.edu.pl>, Beata Myśków <Beata.Myskow@zut.edu.pl>, Stefan Stojałowski <Stefan.Stojalowski@zut.edu.pl>
ECTS (planowane) 5,0 ECTS (formy) 5,0
Forma zaliczenia zaliczenie Język angielski
Blok obieralny Grupa obieralna

Formy dydaktyczne

Forma dydaktycznaKODSemestrGodzinyECTSWagaZaliczenie
laboratoriaL1 30 3,00,40zaliczenie
wykładyW1 20 2,00,60zaliczenie

Wymagania wstępne

KODWymaganie wstępne
W-1Basic knowledge of genetics and molecular biology

Cele przedmiotu

KODCel modułu/przedmiotu
C-1To introduce the student to the basic techniques used in DNA analysis and in the development of genetically modified organisms
C-2Introduction of the student to the newest methods of genome rearrangement

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KODTreść programowaGodziny
laboratoria
T-L-1Principles of health and safety in a genetic engineering laboratory. Purification of plasmid DNA. Plant genomic DNA extraction using columns3
T-L-2Comparison of the purity, yield of prepared DNAs. Determining the efficiency of the methods used2
T-L-3PCR. Optimization of the method. Gradient PCR2
T-L-4Restriction enzymes. Digestion of plasmid vectors. Construction of restriction maps4
T-L-5Restriction digestion of PCR products. Results analysis2
T-L-6Preparation of DNA for cloning. DNA ligation. Transformation of bacteria3
T-L-7Transformants analysis. Plasmid DNA preparation2
T-L-8Restriction DNA analysis of recombinant plasmids. Electrophoresis3
T-L-9PCR-based mutagenesis. Design of primers for PCR reactions2
T-L-10Gene expression analysis based on a reference gene: RNA isolation, reverse transcription, real-time PCR reaction, data analysis7
30
wykłady
T-W-1Genetic engineering. Goals of genetic modification in model and practical aspects, public acceptance2
T-W-2Structure, organization and fundamental functions of the genomes of pro- and eukaryotes2
T-W-3Enzymes used for the recombination and cloning of DNA2
T-W-4Characterization of vectors used in genetic engineering. Plasmid vectors, bacteriophages, cosmids, artificial chromosomes. Capacity, stability, advantages and disadvantages4
T-W-5Molecular cloning. Expression cloning in Escherichia coli and in Saccharomyces cerevisiae2
T-W-6Promoters, marker and reporter genes in gene constructs. Analysis of transgene integration and expression2
T-W-7Gene and genome libraries - development, searching3
T-W-8DNA editing methods, CRISPR/Cas9 system, CRISPRon/off and prime editing3
20

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KODForma aktywnościGodziny
laboratoria
A-L-1participation in laboratories30
A-L-2self-study literature/scientific literature20
A-L-3report preparation25
75
wykłady
A-W-1participation in lectures20
A-W-2Self-study of literature/scientific literature30
50

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KODMetoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1lecture
M-2laboratory

Sposoby oceny

KODSposób oceny
S-1Ocena formująca: presentation
S-2Ocena formująca: report of laboratory activities
S-3Ocena podsumowująca: written test
S-4Ocena podsumowująca: assessment of laboratory skills

Zamierzone efekty uczenia się - wiedza

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
WM-WKSiR_1-_??_W01
The student will gain knowledge of the methods and purposes of the recombination of DNA
C-1M-1S-3

Zamierzone efekty uczenia się - umiejętności

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
WM-WKSiR_1-_??_U01
The student will gain the ability to distinguish and assign basic methods for modifying genomes
C-2M-1, M-2S-3, S-2

Zamierzone efekty uczenia się - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
WM-WKSiR_1-_??_K01
The student is able to work in a group and in laboratory classes, is able to demonstrate the results of research, maintains safety rules
C-1M-2S-1, S-4, S-2

Literatura podstawowa

  1. Desmond S. T. Nicholl, An Introduction to Genetic Engineering, CAMBRIDGE UNIVERSITY PRESS, Published in the United States of America by Cambridge University Press, New York, 2008, Third Edition, eBook (EBL)

Literatura dodatkowa

  1. Işıl Aksan Kurnaz, Techniques in GENETIC ENGINEERING, Taylor & Francis Group, Boca Raton, Fl 33487 2742 USA, 2015, First

Treści programowe - laboratoria

KODTreść programowaGodziny
T-L-1Principles of health and safety in a genetic engineering laboratory. Purification of plasmid DNA. Plant genomic DNA extraction using columns3
T-L-2Comparison of the purity, yield of prepared DNAs. Determining the efficiency of the methods used2
T-L-3PCR. Optimization of the method. Gradient PCR2
T-L-4Restriction enzymes. Digestion of plasmid vectors. Construction of restriction maps4
T-L-5Restriction digestion of PCR products. Results analysis2
T-L-6Preparation of DNA for cloning. DNA ligation. Transformation of bacteria3
T-L-7Transformants analysis. Plasmid DNA preparation2
T-L-8Restriction DNA analysis of recombinant plasmids. Electrophoresis3
T-L-9PCR-based mutagenesis. Design of primers for PCR reactions2
T-L-10Gene expression analysis based on a reference gene: RNA isolation, reverse transcription, real-time PCR reaction, data analysis7
30

Treści programowe - wykłady

KODTreść programowaGodziny
T-W-1Genetic engineering. Goals of genetic modification in model and practical aspects, public acceptance2
T-W-2Structure, organization and fundamental functions of the genomes of pro- and eukaryotes2
T-W-3Enzymes used for the recombination and cloning of DNA2
T-W-4Characterization of vectors used in genetic engineering. Plasmid vectors, bacteriophages, cosmids, artificial chromosomes. Capacity, stability, advantages and disadvantages4
T-W-5Molecular cloning. Expression cloning in Escherichia coli and in Saccharomyces cerevisiae2
T-W-6Promoters, marker and reporter genes in gene constructs. Analysis of transgene integration and expression2
T-W-7Gene and genome libraries - development, searching3
T-W-8DNA editing methods, CRISPR/Cas9 system, CRISPRon/off and prime editing3
20

Formy aktywności - laboratoria

KODForma aktywnościGodziny
A-L-1participation in laboratories30
A-L-2self-study literature/scientific literature20
A-L-3report preparation25
75
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - wykłady

KODForma aktywnościGodziny
A-W-1participation in lectures20
A-W-2Self-study of literature/scientific literature30
50
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięWM-WKSiR_1-_??_W01The student will gain knowledge of the methods and purposes of the recombination of DNA
Cel przedmiotuC-1To introduce the student to the basic techniques used in DNA analysis and in the development of genetically modified organisms
Metody nauczaniaM-1lecture
Sposób ocenyS-3Ocena podsumowująca: written test
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięWM-WKSiR_1-_??_U01The student will gain the ability to distinguish and assign basic methods for modifying genomes
Cel przedmiotuC-2Introduction of the student to the newest methods of genome rearrangement
Metody nauczaniaM-1lecture
M-2laboratory
Sposób ocenyS-3Ocena podsumowująca: written test
S-2Ocena formująca: report of laboratory activities
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięWM-WKSiR_1-_??_K01The student is able to work in a group and in laboratory classes, is able to demonstrate the results of research, maintains safety rules
Cel przedmiotuC-1To introduce the student to the basic techniques used in DNA analysis and in the development of genetically modified organisms
Metody nauczaniaM-2laboratory
Sposób ocenyS-1Ocena formująca: presentation
S-4Ocena podsumowująca: assessment of laboratory skills
S-2Ocena formująca: report of laboratory activities